Pyridoxal phosphate/ja: Difference between revisions

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DXP依存的な生合成経路はいくつかの段階と2つの分岐の収束を必要とし、一方は[[erythrose 4-phosphate/ja|エリスロース4-リン酸]]から[[3-hydroxy-1-aminoacetone phosphate/ja|3-ヒドロキシ-1-アミノアセトンリン酸]]を産生し、もう一方（単一酵素）は[[glyceraldehyde 3-phosphate/ja|グリセルアルデヒド3-リン酸]]（GAP）と[[pyruvate/ja|ピルビン酸]]から[[deoxyxylulose 5-phosphate/ja|デオキシルロース5-リン酸]]（DXP）を産生する。[[3-hydroxy-1-aminoacetone phosphate/ja|3-ヒドロキシ-1-アミノアセトンリン酸]]と[[deoxyxylulose 5-phosphate/ja|デオキシルロース5-リン酸]]の縮合物は[[pyridoxine 5'-phosphate/ja|ピリドキシン5'-リン酸]]である。この縮合は''pdxJ''にコードされる[[PNP synthase/ja|PNP合成酵素]]によって触媒され、PNP（ピリドキシン5'リン酸）を生成する。最後の酵素はPNPオキシダーゼ（''pdxH''）で、ジオキシゲンを用いて4'水酸基をアルデヒドに酸化し、過酸化水素を生成する。

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最初の分岐は、''大腸菌''では''epd''、''pdxB''、''serC''および''pdxA''にコードされる酵素によって触媒される。これらは、セリン生合成の3つの酵素（''serA''（''pdxB''のホモログ）、''serC''、''serB''-ただし、''epd''は''gap''のホモログ）と機構的な類似性と相同性を共有しており、2つの経路の進化的起源を共有している。いくつかの生物種では、''大腸菌''の''serC''遺伝子のホモログが2つ存在し、一般的に1つはserオペロン（''serC''）に、もう1つはpdxオペロンに存在し、その場合は''pdxF''と呼ばれる。

~~The first branch is catalyzed in~~ ''~~E. coli~~'' ~~by enzymes encoded by~~ ''epd'', ''pdxB'', ''serC'' ~~and~~ ''pdxA''~~. These share mechanistical similarities and homology with the three enzymes in serine biosynthesis (~~''serA'' ~~(homologue of~~ ''pdxB''), ''serC'', ''serB'' ~~— however,~~ ''epd'' ~~is a homologue of~~ ''gap''~~), which points towards a shared evolutionary origin of the two pathways. In several species there are two homologues of the~~ ''~~E. coli~~'' ''serC'' ~~gene, generally one in a ser operon (~~''serC''~~), and the other in a pdx operon, in which case it is called~~ ''pdxF''.

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 DXP依存的な生合成経路はいくつかの段階と2つの分岐の収束を必要とし、一方は[[erythrose 4-phosphate/ja|エリスロース4-リン酸]]から[[3-hydroxy-1-aminoacetone phosphate/ja|3-ヒドロキシ-1-アミノアセトンリン酸]]を産生し、もう一方（単一酵素）は[[glyceraldehyde 3-phosphate/ja|グリセルアルデヒド3-リン酸]]（GAP）と[[pyruvate/ja|ピルビン酸]]から[[deoxyxylulose 5-phosphate/ja|デオキシルロース5-リン酸]]（DXP）を産生する。[[3-hydroxy-1-aminoacetone phosphate/ja|3-ヒドロキシ-1-アミノアセトンリン酸]]と[[deoxyxylulose 5-phosphate/ja|デオキシルロース5-リン酸]]の縮合物は[[pyridoxine 5'-phosphate/ja|ピリドキシン5'-リン酸]]である。この縮合は''pdxJ''にコードされる[[PNP synthase/ja|PNP合成酵素]]によって触媒され、PNP（ピリドキシン5'リン酸）を生成する。最後の酵素はPNPオキシダーゼ（''pdxH''）で、ジオキシゲンを用いて4'水酸基をアルデヒドに酸化し、過酸化水素を生成する。
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+最初の分岐は、''大腸菌''では''epd''、''pdxB''、''serC''および''pdxA''にコードされる酵素によって触媒される。これらは、セリン生合成の3つの酵素（''serA''（''pdxB''のホモログ）、''serC''、''serB''-ただし、''epd''は''gap''のホモログ）と機構的な類似性と相同性を共有しており、2つの経路の進化的起源を共有している。いくつかの生物種では、''大腸菌''の''serC''遺伝子のホモログが2つ存在し、一般的に1つはserオペロン（''serC''）に、もう1つはpdxオペロンに存在し、その場合は''pdxF''と呼ばれる。
-The first branch is catalyzed in ''E. coli'' by enzymes encoded by ''epd'', ''pdxB'', ''serC'' and ''pdxA''. These share mechanistical similarities and homology with the three enzymes in serine biosynthesis (''serA'' (homologue of ''pdxB''), ''serC'', ''serB'' — however, ''epd'' is a homologue of ''gap''), which points towards a shared evolutionary origin of the two pathways. In several species there are two homologues of the ''E. coli'' ''serC'' gene, generally one in a ser operon (''serC''), and the other in a pdx operon, in which case it is called ''pdxF''.
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