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歴史的には、薬物は伝統的な治療法から有効成分を同定したり、[[serendipity/ja|偶然の発見]]によって発見されてきた。その後、合成[[small molecule/ja|低分子化合物]]、[[natural product/ja|天然物]]、[[extract/ja|抽出物]]からなる[[chemical library/ja|化学物質ライブラリー]]が、無傷の細胞や全生物を用いてスクリーニングされ、[[classical pharmacology/ja|古典的薬理学]]として知られるプロセスで、望ましい[[therapeutic/ja|治療]]効果を持つ物質が同定された。[[human genome/ja|ヒトゲノム]]の[[Human Genome Project/ja|塩基配列]]が解読され、大量の精製タンパク質の迅速なクローニングと合成が可能になってからは、[[reverse pharmacology/ja|リバース・ファーマコロジー]](逆薬理学)として知られるプロセスで、[[Disease-modifying treatment/ja|疾患修飾作用]]があると仮定される単離された[[biological target/ja|生物学的標的]]に対して、大量の化合物ライブラリーを[[high throughput screening/ja|ハイスループットスクリーニング]]することが一般的になった。このようなスクリーニングで得られたヒット化合物は、細胞で、そして動物で[[efficacy/ja|有効性]]が検証される。さらに最近になって、科学者たちは生体分子の形状を原子レベルで理解することができるようになり、その知識を利用して薬物候補をデザインすることができるようになった([[drug design/ja|ドラッグ・デザイン]]を参照)。
歴史的には、薬物は伝統的な治療法から有効成分を同定したり、[[serendipity/ja|偶然の発見]]によって発見されてきた。その後、合成[[small molecule/ja|低分子化合物]]、[[natural product/ja|天然物]]、[[extract/ja|抽出物]]からなる[[chemical library/ja|化学物質ライブラリー]]が、無傷の細胞や全生物を用いてスクリーニングされ、[[classical pharmacology/ja|古典的薬理学]]として知られるプロセスで、望ましい[[therapeutic/ja|治療]]効果を持つ物質が同定された。[[human genome/ja|ヒトゲノム]]の[[Human Genome Project/ja|塩基配列]]が解読され、大量の精製タンパク質の迅速なクローニングと合成が可能になってからは、[[reverse pharmacology/ja|リバース・ファーマコロジー]](逆薬理学)として知られるプロセスで、[[Disease-modifying treatment/ja|疾患修飾作用]]があると仮定される単離された[[biological target/ja|生物学的標的]]に対して、大量の化合物ライブラリーを[[high throughput screening/ja|ハイスループットスクリーニング]]することが一般的になった。このようなスクリーニングで得られたヒット化合物は、細胞で、そして動物で[[efficacy/ja|有効性]]が検証される。さらに最近になって、科学者たちは生体分子の形状を原子レベルで理解することができるようになり、その知識を利用して薬物候補をデザインすることができるようになった([[drug design/ja|ドラッグ・デザイン]]を参照)。


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現代の創薬では、[[Affinity (pharmacology)#Protein-ligand binding/ja|親和性]][[binding selectivity/ja|選択性]](副作用の可能性を減らす)、有効性/[[potency (pharmacology)/ja|効力]][[Metabolism/ja|代謝]]安定性([[Biological half-life/ja|半減期]]を長くする)、経口[[bioavailability/ja|バイオアベイラビリティ]]を高めるために、スクリーニングでヒットした[[medicinal chemistry/ja|化合物]]を特定し、薬化学的に最適化する。これらの要件をすべて満たす化合物が同定されると、[[clinical trial/ja|臨床試験]]に先立ち、[[drug development/ja|薬物開発]]のプロセスが開始される。これらのステップの1つ以上には、必ずしも[[computer-aided drug design/ja|コンピュータ支援薬物設計]]が含まれるとは限らない。
Modern drug discovery involves the identification of screening hits, [[medicinal chemistry|medicinal chemistry]] and optimization of those hits to increase the [[Affinity (pharmacology)#Protein-ligand binding|affinity]], [[binding selectivity|selectivity]] (to reduce the potential of side effects), efficacy/[[potency (pharmacology)|potency]], [[Metabolism|metabolic]] stability (to increase the [[Biological half-life|half-life]]), and oral [[bioavailability|bioavailability]]. Once a compound that fulfills all of these requirements has been identified, it will begin the process of [[drug development|drug development]] prior to [[clinical trial|clinical trial]]s. One or more of these steps may, but not necessarily, involve [[computer-aided drug design|computer-aided drug design]].
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