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- 12:05, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/63/ja (Created page with "===非タンパク質性アミノ酸=== {{main/ja|Non-proteinogenic amino acids/ja}}")
- 12:05, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/62/ja (Created page with "''N''-ホルミルメチオニン（細菌、ミトコンドリア、葉緑体のタンパク質の初期アミノ酸であることが多い）は、一般に、別のタンパク質生成アミノ酸としてではなく、メチオニンの一形態として考えられている。自然界には存在しないコドン-tRNAの組み合わせも、Expanded genetic...")
- 12:03, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/61/ja (Created page with "2つの非標準タンパク質生成アミノ酸は、セレノシステイン（多くの非真核生物とほとんどの真核生物に存在するが、DNAによって直接コードされていない）とピロリジン（いくつかの古細菌と少なくとも1つの細菌にのみ存在する）である。これらの非標準アミノ酸が組み込まれることは稀である。例えば、25のヒトタ...")
- 12:02, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/60/ja (Created page with "普遍的な遺伝コードのコドンによって直接コードされる20種類のアミノ酸は、''標準''または''カノニカル''アミノ酸と呼ばれる。メチオニンの修飾型（''N''-ホルミルメチオニン）は、バクテリア、ミトコンドリア、葉緑体のタンパク質の初期アミノ酸として、メチオニンの代わりに組み込まれることが多い。その他のアミノ酸は''非標...")
- 12:01, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/59/ja (Created page with "===標準アミノ酸と非標準アミノ酸の比較===")
- 12:00, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/58/ja (Created page with "いくつかの独立した進化学的研究により、Gly、Ala、Asp、Val、Ser、Pro、Glu、Leu、Thrは初期の遺伝暗号を構成していたアミノ酸群に属し、Cys、Met、Tyr、Trp、His、Pheは後に遺伝暗号に追加されたアミノ酸群に属する可能性が示唆されている。")
- 12:00, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/57/ja (Created page with "22種類のアミノ酸は自然にポリペプチドに組み込まれ、タンパク原性または天然アミノ酸と呼ばれる。このうち20種類は普遍的な遺伝暗号によってコード化されている。残りの2つ、selenocysteineセレノシステインとピロリジンは、独自の合成機構によってタンパク質に組み込まれる。セレノシステインは、翻訳されるmRNAに[...")
- 11:59, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/56/ja (Created page with "アミノ酸はタンパク質の前駆体である。アミノ酸は縮合反応によって結合し、ペプチドと呼ばれる短いポリマー鎖、あるいはポリペプチドまたはタンパク質と呼ばれる長い鎖を形成する。これらの鎖は直鎖状で枝分かれしておらず、鎖内の各アミノ酸残基は隣接する2つのアミノ酸に結合している。自然界では、DNA/RNA遺伝物質によってコードされたタン...")
- 11:54, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/55/ja (Created page with "===タンパク質生成アミノ酸=== {{main/ja|Proteinogenic amino acid/ja}} {{See also/ja|Protein primary structure/ja|Posttranslational modification/ja}}")
- 11:54, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/54/ja (Created page with "<!--image 7--> | image7 = Selenocysteine skeletal 3D.svg | alt7 = セレノシステインの構造を示す図 | width7 = | height7 = | caption7 = アミノ酸セレノシステイン }}")
- 11:53, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/53/ja (Created page with "<!--image 6--> | image6 = Beta alanine comparison.svg | alt6 = β-アラニンとα-アラニンの構造比較図 | width6 = | height6 = | caption6 = β-アラニンとそのα-アラニン異性体")
- 11:53, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/52/ja (Created page with "<!--image 5--> | image5 = Protein primary structure.svg | alt5 = タンパク質は、アミノ酸を表す円がつながった、枝分かれしていない長いひもとして描かれる | width5 = | height5 = | caption5 = ポリペプチドはアミノ酸の分岐していない鎖である")
- 11:53, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/51/ja (Created page with "==生化学における存在と機能== {{Anchor|Occurrence and functions in biochemistry}} {{multiple image <!-- Layout parameters --> | align = right | direction = vertical | total_width = 340 <!-- Header --> | header_align = <!-- center (default), left, right --> | header =")
- 11:52, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/50/ja (Created page with "さらに、多くの非標準アミノ酸は特定のコードを持っている。例えば、ボルテゾミブやMG132などのいくつかのペプチド薬物は、人工合成され、特定のコードを持つ保護基を保持している。ボルテゾミブはPyz-Phe-boroLeuであり、MG132はZ-Leu-L...")
- 11:51, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/49/ja (Created page with "'''Ter'''または'''*'''(terminationから)は、停止コドンが発生した場合のタンパク質の変異の表記に使われる。これはアミノ酸が全くないことに相当する。")
- 11:50, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/48/ja (Created page with "'''Xaa'''の代わりに'''Unk'''が使われることもあるが、標準的ではない。")
- 11:50, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/47/ja (Created page with "{| class="wikitable" style="text-align:center;" |- ! あいまいなアミノ酸 ! 3文字 ! 1文字 ! 含まれるアミノ酸 ! 含まれるコドン |- | いずれか／不明 | Xaa | X | All | NNN |- | Asparagine/jaあるいはaspartate/ja | Asx | B | D, N | RAY |- | Glutamine/jaあるいはglutamate/ja | Glx | Z | E, Q | SAR |- | Leucine/jaあるいはイソロイシン | Xle | J | I, L | YTR, ATH, CTY |- | Hydrophobic/ja | | Φ | V, I, L, F,...")
- 11:47, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/46/ja (Created page with "特定のアミノ酸コードに加えて、プレースホルダーは、ペプチドやタンパク質の化学的または結晶学的解析で残基の同一性を決定できない場合に使用される。また、保存タンパク質配列モチーフを要約するためにも使われる。類似した残基の集合を示すために単一の文字を使用することは、Nu...")
- 11:46, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/45/ja (Created page with "{| class="wikitable" style="text-align:center;" |- ! 21番目と22番目のアミノ酸 ! 3文字 ! 1文字 ! Molecular mass/ja |- | Selenocysteine/ja | Sec | U | 168.064 |- | Pyrrolysine/ja | Pyl | O | 255.313 |}")
- 11:45, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/44/ja (Created page with "通常ストップコドンと解釈されるコドンによって、さらに2つのアミノ酸がコードされている種もある：")
- 11:45, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/43/ja (Created page with "{| class="wikitable sortable" style="text-align:center;" ! rowspan=2 | アミノ酸 ! colspan=2 | 3 と 1文字記号 ! colspan=3 | 側鎖 ! rowspan=2 | ハイドロパシー<br/>i指数 ! colspan=2 | Molar absorptivity/ja ! rowspan=2 | Molecular mass/ja ! rowspan=2 | タンパク質中の<br/>存在量 (%) ! rowspan=2 | 標準的な遺伝子コーディング、<br/>IUPAC表記法 |- ! 3 ! 1 ! ク...")
- 11:33, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/42/ja (Created page with "* 曖昧さがない場合は頭文字を用いる： Cシステイン、Hヒスチジン、Iイソロイシン、Mメチオニン、Sセリン、Vバリン、 * 任意の割り当てが必要な場合は、構造的に単純なアミノ酸を優先する： A アラニン、G グリシン、L ロイシン、P プロリン、T スレオニン、 * F''PH''エニルアラニンとR a''R''ジニンは、音韻的に暗示的であることによって割り当てられる...")
- 11:32, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/41/ja (Created page with "1文字表記は、IUPAC-IUBが以下の規則に基づいて選択した：")
- 11:31, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/40/ja (Created page with "表には1文字記号が含まれているが、IUPAC-IUBMBは「1文字記号の使用は長い配列の比較に限定すべきである」と勧告している。")
- 11:31, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/39/ja (Created page with "===標準的なアミノ酸の略語と性質の表=== {{Main/ja|Proteinogenic amino acid/ja}}")
- 11:31, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/38/ja (Created page with "多くのタンパク質は様々な翻訳後修飾を受け、それによってアミノ酸残基の側鎖に追加の化学基が付加され、時にはリポタンパク質（疎水性）や糖タンパク質（親水性）を生成し、タンパク質が膜に一時的に付着できるようになる。例えば、シグナル伝達タンパク質は、脂肪酸palmitic acid/ja|パル...")
- 11:30, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/37/ja (Created page with "一方、システイン、フェニルアラニン、トリプトファン、メチオニン、バリン、ロイシン、イソロイシンは、反応性が高く、複雑で、疎水性である。")
- 11:30, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/36/ja (Created page with "アミノ酸の中には特殊な性質を持つものがある。システインは他のシステイン残基と共有結合ジスルフィド結合を形成することができる。プロリンはポリペプチド骨格に環状を形成し、グリシンは他のアミノ酸よりも柔軟である。")
- 11:29, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/35/ja (Created page with "==物理化学的性質== {{Anchor|Physicochemical properties}} 20種類のアミノ酸は、その性質によって分類することができる。重要な要素は、電荷、親水性または疎水性、サイズ、および官能基である。これらの特性はタンパク質構造やタンパク質間相互作用に影響を与える。水溶性タンパ...")
- 11:24, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/34/ja (Created page with "アミノ酸は電気泳動において等電点での移動度がゼロであるが、この挙動は単一アミノ酸よりもペプチドやタンパク質の方が通常利用される。双性イオンは等電点での溶解度が最小であり、一部のアミノ酸（特に非極性側鎖を持つもの）はpHを必要な等電点に調整することで水から沈殿させて単離することができる。")
- 11:23, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/33/ja (Created page with "グルタミン酸（アスパラギン酸に似ている）だけでなく、システイン、ヒスチジン、リジン、チロシン、アルギニンなど、イオン化可能な側鎖を持つ他のアミノ酸にも同様の考察が当てはまる。")
- 11:23, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/32/ja (Created page with "荷電側鎖を持つアミノ酸の場合、側鎖のp''K''<sub>a</sub>が関与する。したがって、負の側鎖を持つアスパラギン酸やグルタミン酸の場合、末端アミノ基は基本的に完全に荷電形{{chem2|\sNH3+}}であるが、この正の電荷は、ただ1つのC末端カルボキシレート基が負に荷電している状態と釣り合う必要がある。これは2つのカルボキシレートp''K''<sub>a</sub>値の中間で...")
- 11:22, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/31/ja (Created page with "荷電していない側鎖を持つアミノ酸の場合、2つのp''K''<sub>a</sub>値の間のpH値では双性イオンが優勢であるが、少量の正負イオンと平衡で共存する。2つのp''K''<sub>a</sub>値の中間点では、微量の正負イオンと微量の正イオンが釣り合い、存在するすべての形態の平均正電荷はゼロになる。このpHは等電点p''I''と呼ばれ...")
- 11:21, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/30/ja (Created page with "===等電点=== thumb|right|360px|20種類のタンパク質生成アミノ酸の[[:en:titration curve|滴定曲線を側鎖のカテゴリー別にグループ化したものである。]]")
- 11:20, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/29/ja (Created page with "酸や塩基の定義は、化学の世界では様々なものが使われているが、水溶液中の化学に有用なのは、ブレンステッドの理論だけである：酸とは、他の種にプロトンを供与できる種であり、塩基とは、プロトンを受容できる種である。この基準を用いて、上の図では基を表示している。アスパラギン酸残基とグルタミン酸残...")
- 11:19, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/28/ja (Created page with "強酸性条件下（pH3以下）では、カルボン酸基がプロトン化され、構造はアンモニオカルボン酸{{chem2|NH3+\sCHR\sCO2H}}となる。これは、哺乳類の胃やリソソームなどの酸性環境で活性を発揮するペプシンのような酵素には関係するが、細胞内酵素にはあまり当てはまらない。高塩基性条件下（pH10以上、生理的条件下では通常見られない）では、ア...")
- 11:18, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/27/ja (Created page with "thumb|upright=1.8|アミノ酸残基のN末端アミノ基、C末端カルボン酸基、側鎖のイオン化とブレンステッド特性 アミノ酸の一般的な天然型は、{{chem2|\sNH3+}}（プロリンの場合は{{chem2|\sNH2+\s}}）と{{chem2|\sCO2-}}官能基が同じC原子に結合した双性イオン構造を持つ。リボソームで翻訳される過程でタンパ...")
- 11:13, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/26/ja (Created page with "===双性イオン=== {{main/ja|Zwitterion/ja}}")
- 11:12, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/25/ja (Created page with "==== β-アミノ酸とγ-アミノ酸 ==== カルノシンや他のいくつかのペプチドの成分であるβ-アラニンなど、構造{{chem2|NH3+\sCXY\sCXY\sCO2-}}を持つアミノ酸はβ-アミノ酸である。構造{{chem2|NH3+\sCXY\sCXY\sCXY\sCO2-}}を持つものはγ-アミノ酸であり、XとYは2つの置換基（一方は通常H）である。")
- 11:11, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/24/ja (Created page with "いくつかの側鎖は、荷電性、極性、疎水性のカテゴリーではうまく説明できない。グリシン（Gly, G）は、そのサイズが小さいため、アミノ基とカルボキシレート基によって溶解度が大きく左右されることから、極性アミノ酸と考えられる。しかし、グリシンには側鎖がないため、アミノ酸の中でも独特の柔軟性があり、タンパク質のフォール...")
- 11:10, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/23/ja (Created page with "==== 特別な場合の側鎖 ====")
- 11:10, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/22/ja (Created page with "非極性アミノ酸の相互作用は、折りたたみタンパク質が機能的な三次元構造になる過程の主要な原動力である。これらのアミノ酸の側鎖はいずれも容易にイオン化しないため、チロシン（Tyr、Y）を除いてpK<sub>a</sub>を持たない。チロシンの水酸基は高いpHで脱プロトン化し、負に帯電したフェノラートを形成する。このため...")
- 11:09, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/21/ja (Created page with "==== 疎水性側鎖 ====")
- 11:09, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/20/ja (Created page with "セリン（Ser, S）、スレオニン（Thr, T）、アスパラギン（Asn, N）、グルタミン（Gln, Q）は、水や他のアミノ酸と容易に水素結合を形成する。通常の状態ではイオン化しないが、セリンプロテアーゼの触媒セリンは例外である。これは深刻な摂動の例であり、一般的なセリン残...")
- 11:06, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/19/ja (Created page with "==== 極性荷電側鎖 ====")
- 11:06, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/18/ja (Created page with "アルギニン（Arg、R）、リジン（Lys、K）、ヒスチジン（His、H）の3つである。アルギニンは荷電したグアニジン基を持ち、リジンは荷電したアルキルアミノ基を持ち、pH7で完全にプロトン化される。ヒスチジンのイミダゾール基はpK<sub>a</sub>が6.0であり、中性pHでは10%程度しかプロトン化されない。ヒスチジ...")
- 11:02, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/17/ja (Created page with "thumb|450x450px|ヒスチジン（左）、リジン（中）、アルギニン（右）に見られる官能基")
- 11:01, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/16/ja (Created page with "中性pHで負に帯電した2つのアミノ酸は、アスパラギン酸（Asp、D）とグルタミン酸（Glu、E）である。アニオン性カルボキシレート基は、ほとんどの状況でブレンステッド塩基として振る舞う。哺乳類の胃に存在するアスパラギン酸プロテアーゼペプシンのように、非常に低いpH環...")
- 10:59, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/15/ja (Created page with "5つのアミノ酸は中性pHで電荷を持つ。多くの場合、これらの側鎖はタンパク質の表面に現れ、水への溶解を可能にする。反対の電荷を持つ側鎖は、塩橋と呼ばれる重要な静電的接触を形成し、1つのタンパク質内または相互作用するタンパク質間の構造を維持する。多くのタンパク質は金属を特異的にその構造に結合さ...")
- 10:58, 29 March 2024 Fire talk contribs created page Translations:Amino acid/14/ja (Created page with "==== 極性荷電側鎖 ====")
