Protein/ja: Difference between revisions

Protein/ja
Created page with "構造ゲノミクスの分野を補完するものとして、''タンパク質構造予測''は、タンパク質の効率的な数学モデルを開発し、実験室での観察によって構造を検出する代わりに、理論的に分子形成を計算で予測する。相同性モデリングとして知られる構造予測の最も成功したタイプは、モデル化されるタンパク質と配列が..."
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===構造予測===
===Structure prediction===
[[File:225 Peptide Bond-01.jpg|thumb|right|upright=1.6|構成アミノ酸を分析することで、タンパク質の二次構造、三次構造、四次構造を予測することができる。
[[File:225 Peptide Bond-01.jpg|thumb|right|upright=1.6|Constituent amino-acids can be analyzed to predict secondary, tertiary and quaternary protein structure, in this case hemoglobin containing [[heme]] units]]
この場合、ヘモグロビンは[[heme/ja|ヘム]]ユニットを含む]]
{{Main|Protein structure prediction|List of protein structure prediction software}}
{{Main/ja|Protein structure prediction/ja|List of protein structure prediction software/ja}}
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構造ゲノミクスの分野を補完するものとして、''タンパク質構造予測''は、タンパク質の効率的な[[:en:mathematical model|数学モデル]]を開発し、実験室での観察によって構造を検出する代わりに、理論的に分子形成を計算で予測する。相[[:en:homology modeling|同性モデリング]]として知られる構造予測の最も成功したタイプは、モデル化されるタンパク質と配列が類似している「鋳型」構造の存在に依存している。構造ゲノミクスの目標は、残された構造のほとんどをモデル化するために、解決された構造に十分な表現を提供することである。遠縁のテンプレート構造しか利用できない場合、正確なモデルを作成することは依然として困難であるが、[[sequence alignment/ja|配列アライメント]]がこのプロセスのボトルネックであることが示唆されている。多くの構造予測手法は、[[protein engineering/ja|タンパク質工学]]という新たな分野への情報提供に役立っており、そこではすでに新規なタンパク質フォールドが設計されている。また、タンパク質(真核生物では〜33%)には、構造化されていないが生物学的に機能する大きな部分があり、[[intrinsically disordered proteins/ja|本質的に無秩序なタンパク質]]として分類される。したがって、タンパク質の無秩序を予測・解析することは、タンパク質構造解析の重要な一部である。
構造ゲノミクスの分野を補完するものとして、''タンパク質構造予測''は、タンパク質の効率的な[[:en:mathematical model|数学モデル]]を開発し、実験室での観察によって構造を検出する代わりに、理論的に分子形成を計算で予測する。相[[:en:homology modeling|同性モデリング]]として知られる構造予測の最も成功したタイプは、モデル化されるタンパク質と配列が類似している「鋳型」構造の存在に依存している。構造ゲノミクスの目標は、残された構造のほとんどをモデル化するために、解決された構造に十分な表現を提供することである。遠縁のテンプレート構造しか利用できない場合、正確なモデルを作成することは依然として困難であるが、[[sequence alignment/ja|配列アライメント]]がこのプロセスのボトルネックであることが示唆されている。多くの構造予測手法は、[[protein engineering/ja|タンパク質工学]]という新たな分野への情報提供に役立っており、そこではすでに新規なタンパク質フォールドが設計されている。また、タンパク質(真核生物では〜33%)には、構造化されていないが生物学的に機能する大きな部分があり、[[intrinsically disordered proteins/ja|本質的に無秩序なタンパク質]]として分類される。したがって、タンパク質の無秩序を予測・解析することは、タンパク質構造解析の重要な一部である。