Protein/ja: Difference between revisions

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タンパク質は主に配列と構造によって分類されるが、その他の分類も一般的に用いられている。特に酵素については、EC番号システムが機能的な分類スキームを提供している。同様に、[[Gene Ontology/ja遺伝子オントロジー]]では、遺伝子とタンパク質の両方を生物学的・生化学的機能によって分類しているが、細胞内の位置によっても分類している。

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配列の類似性は、進化的類似性と機能的類似性の両方の観点からタンパク質を分類するために使用される。特に[[Protein domain/ja#Multidomain proteins|マルチドメインタンパク質]]では、タンパク質全体または[[protein domain/ja|タンパク質ドメイン]]のいずれかを使用することができる。タンパク質ドメインは、配列、構造、機能の組み合わせによるタンパク質の分類を可能にし、それらは多くの異なる方法で組み合わせることができる。17万個のタンパク質を対象とした初期の研究では、約3分の2のタンパク質に少なくとも1つのドメインが割り当てられ、より大きなタンパク質ほど多くのドメインを含んでいた（例えば、600[[amino acid/ja|アミノ酸]]以上のタンパク質は平均5つ以上のドメインを持つ）。

~~Sequence similarity is used to classify proteins both in terms of evolutionary and functional similarity. This may use either whole proteins or [[protein domain]]s, especially in~~ [[Protein domain#Multidomain proteins|~~multi-domain proteins~~]]~~. Protein domains allow~~ protein ~~classification by a combination of sequence, structure and function, and thy can be combined in many different ways. In an early study of 170,000 proteins, about two-thirds were assigned at least one~~ domain~~, with larger proteins containing more domains (e.g. proteins larger than 600~~ [[amino acid]]~~s having an average of more than 5 domains).~~

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 タンパク質は主に配列と構造によって分類されるが、その他の分類も一般的に用いられている。特に酵素については、EC番号システムが機能的な分類スキームを提供している。同様に、[[Gene Ontology/ja遺伝子オントロジー]]では、遺伝子とタンパク質の両方を生物学的・生化学的機能によって分類しているが、細胞内の位置によっても分類している。
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+配列の類似性は、進化的類似性と機能的類似性の両方の観点からタンパク質を分類するために使用される。特に[[Protein domain/ja#Multidomain proteins|マルチドメインタンパク質]]では、タンパク質全体または[[protein domain/ja|タンパク質ドメイン]]のいずれかを使用することができる。タンパク質ドメインは、配列、構造、機能の組み合わせによるタンパク質の分類を可能にし、それらは多くの異なる方法で組み合わせることができる。17万個のタンパク質を対象とした初期の研究では、約3分の2のタンパク質に少なくとも1つのドメインが割り当てられ、より大きなタンパク質ほど多くのドメインを含んでいた（例えば、600[[amino acid/ja|アミノ酸]]以上のタンパク質は平均5つ以上のドメインを持つ）。
-Sequence similarity is used to classify proteins both in terms of evolutionary and functional similarity. This may use either whole proteins or [[protein domain]]s, especially in [[Protein domain#Multidomain proteins|multi-domain proteins]]. Protein domains allow protein classification by a combination of sequence, structure and function, and thy can be combined in many different ways. In an early study of 170,000 proteins, about two-thirds were assigned at least one domain, with larger proteins containing more domains (e.g. proteins larger than 600 [[amino acid]]s having an average of more than 5 domains).
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