Citric acid cycle/ja: Difference between revisions

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大きく変動するステップは、コハク酸へのコハク酸-CoAの変換である。ほとんどの生物は、[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.5 EC 6.2.1.5]のコハク酸-CoAリガーゼ（ADP形成）を利用している（その名前にもかかわらず、この酵素はATP形成方向の経路で作用する）。哺乳類では、GTP形成酵素であるコハク酸-CoAリガーゼ（GDP形成）（[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 EC 6.2.1.4]）も働いている。各アイソフォームの利用度は組織に依存する。Acetobacter aceti''のようないくつかの酢酸産生菌では、全く別の酵素がこの変換を触媒する - [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.18 EC 2.8.3.18]、succinyl-CoA:acetate CoA-transferaseである。この特殊な酵素は、これらの生物においてTCAサイクルと酢酸代謝を結びつけている。ヘリコバクター・ピロリ（''Helicobacter pylori''）などの一部の細菌は、この変換にさらに別の酵素を用いる。

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その前の段階である2-オキソグルタル酸からスクシニル-CoAへの変換にも、いくつかの変異が存在する。ほとんどの生物はどこにでもあるNAD<sup>+</sup>依存性の2-オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼを利用しているが、一部の細菌はフェレドキシン依存性の2-オキソグルタル酸[[合成酵素]]（[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.7.3 EC 1.2.7.3]）を利用している。

~~Some variability also exists at the previous step – the conversion of 2~~-~~oxoglutarate to succinyl~~-~~CoA. While most organisms utilize the ubiquitous NAD~~<sup>+</sup>-~~dependent 2-oxoglutarate dehydrogenase, some bacteria utilize a ferredoxin-dependent 2~~-~~oxoglutarate~~ [[~~synthase~~]] ([http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.7.3 EC 1.2.7.3]).

義務的独立栄養細菌やメタン栄養細菌、古細菌を含む他の生物は、スクシニルCoAを完全にバイパスし、[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=4.1.1.71 EC 4.1.1.71]の2-オキソグルタル酸デカルボキシラーゼと[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.1.79 EC 1.2.1.79]のスクシネートセミアルデヒドデヒドロゲナーゼを用いて、2-オキソグルタル酸をコハク酸セミアルデヒドを介してコハク酸に変換する。

~~Other organisms, including obligately autotrophic and methanotrophic bacteria and archaea, bypass succinyl-CoA entirely, and convert 2-oxoglutarate to succinate via succinate semialdehyde, using~~ [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=4.1.1.71 EC 4.1.1.71]~~, 2~~-~~oxoglutarate decarboxylase, and~~ [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.1.79 EC 1.2.1.79]~~, succinate~~-~~semialdehyde dehydrogenase.~~

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 大きく変動するステップは、コハク酸へのコハク酸-CoAの変換である。ほとんどの生物は、[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.5 EC 6.2.1.5]のコハク酸-CoAリガーゼ（ADP形成）を利用している（その名前にもかかわらず、この酵素はATP形成方向の経路で作用する）。哺乳類では、GTP形成酵素であるコハク酸-CoAリガーゼ（GDP形成）（[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 EC 6.2.1.4]）も働いている。各アイソフォームの利用度は組織に依存する。Acetobacter aceti''のようないくつかの酢酸産生菌では、全く別の酵素がこの変換を触媒する&nbsp;- [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.18 EC 2.8.3.18]、succinyl-CoA:acetate CoA-transferaseである。この特殊な酵素は、これらの生物においてTCAサイクルと酢酸代謝を結びつけている。ヘリコバクター・ピロリ（''Helicobacter pylori''）などの一部の細菌は、この変換にさらに別の酵素を用いる。
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+その前の段階である2-オキソグルタル酸からスクシニル-CoAへの変換にも、いくつかの変異が存在する。ほとんどの生物はどこにでもあるNAD<sup>+</sup>依存性の2-オキソグルタル酸デヒドロゲナーゼを利用しているが、一部の細菌はフェレドキシン依存性の2-オキソグルタル酸[[合成酵素]]（[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.7.3 EC 1.2.7.3]）を利用している。
-Some variability also exists at the previous step&nbsp;– the conversion of 2-oxoglutarate to succinyl-CoA. While most organisms utilize the ubiquitous NAD<sup>+</sup>-dependent 2-oxoglutarate dehydrogenase, some bacteria utilize a ferredoxin-dependent 2-oxoglutarate [[synthase]] ([http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.7.3 EC 1.2.7.3]).
+義務的独立栄養細菌やメタン栄養細菌、古細菌を含む他の生物は、スクシニルCoAを完全にバイパスし、[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=4.1.1.71 EC 4.1.1.71]の2-オキソグルタル酸デカルボキシラーゼと[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.1.79 EC 1.2.1.79]のスクシネートセミアルデヒドデヒドロゲナーゼを用いて、2-オキソグルタル酸をコハク酸セミアルデヒドを介してコハク酸に変換する。
-Other organisms, including obligately autotrophic and methanotrophic bacteria and archaea, bypass succinyl-CoA entirely, and convert 2-oxoglutarate to succinate via succinate semialdehyde, using [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=4.1.1.71 EC 4.1.1.71], 2-oxoglutarate decarboxylase, and [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.2.1.79 EC 1.2.1.79], succinate-semialdehyde dehydrogenase.
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