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Protein/ja: Revision history

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Protein/ja

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23 April 2024

25 February 2024

  • curprev 11:4411:44, 25 February 2024 Fire talk contribs 71,558 bytes +143 Created page with "遺伝子配列はタンパク質構造よりも多く知られている。さらに、解明された構造セットは、主要な構造決定手法の一つであるX線結晶構造解析で必要とされる条件を容易に適用できるタンパク質に偏っている。特に、球状タンパク質は、X線結晶構造解析に向けた結晶化が比較的容易である。一方、膜タンパク質や大き..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:5210:52, 25 February 2024 Fire talk contribs 71,415 bytes +517 Created page with "===構造決定=== タンパク質の3次構造、あるいは複合体の4次構造を発見することは、タンパク質がどのようにその機能を発揮し、どのようにその機能に影響を与えることができるのか、つまり薬物設計において重要な手がかりを提供することができる。タンパク質は回折限界系:en:Optical microscope|光学顕..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:4310:43, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,898 bytes +280 Created page with "===プロテオミクス=== {{Main/ja|Proteomics/ja}} このような大規模なデータセットの研究は、プロテオミクスの分野を定義しており、ゲノミクスの関連分野との類似から名付けられた。プロテオミクスの主要な実験技術には、多くのタンパク質の分離を可能にする2D電気泳動、タンパク質の迅..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:3810:38, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,618 bytes +126 Created page with "部位特異的突然変異誘発として知られるもうひとつの遺伝子工学的応用によって、研究者はタンパク質の配列を変えることができ、それによってその構造、細胞局在性、制御に対する感受性を変えることができる。この技術によって、改変されたtRNAを用いて非天然アミノ酸をタンパク質に組み込むことも可能になり、新しい性質..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:2910:29, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,492 bytes −1 Created page with "最後に、細胞局在化の最も標準的な方法は、免疫電子顕微鏡法である。この手法も、古典的な電子顕微鏡法とともに、目的のタンパク質に対する抗体を用いる。試料は通常の電子顕微鏡検査用に調製され、次に極めて電気密度の高い物質（通常は金）に結合した目的のタンパク質に対する抗体で処理される。これにより、超微細..."
  • curprev 10:2610:26, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,493 bytes −13 Created page with "他の可能性も存在する。例えば、免疫組織化学では通常、1つ以上の目的のタンパク質に対する抗体を使用し、酵素と結合させて発光シグナルまたは発色シグナルを得る。もう一つの適用可能な手法は、アイソピクニック遠心分離を用いたスクロース（または他の物質）勾配での共分離である。この技術は、..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:2510:25, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,506 bytes +64 Created page with "タンパク質の細胞内局在を解明する他の方法では、小胞体、ゴルジ体、リソソームや液胞、ミトコンドリア、葉緑体、細胞膜などの領域について、既知のコンパートメントマーカーを使用する必要がある。これらのマーカーに蛍光タグを付けたものや、既知のマーカーに対する抗体を用いることで、目的のタンパク質の局在を同定することがより簡単に..."
  • curprev 10:1610:16, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,442 bytes +183 Created page with "タンパク質の''生体内''研究は、多くの場合、細胞内でのタンパク質の合成と局在に関係している。多くの細胞内タンパク質は細胞質で合成され、膜結合タンパク質や分泌タンパク質は小胞体で合成されるが、タンパク質がどのようにして特定の小器官や細胞構造に標的化されるかの詳細は不明なこと..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:1210:12, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,259 bytes +8 Created page with "===構造予測=== thumb|right|upright=1.6|構成アミノ酸を分析することで、タンパク質の二次構造、三次構造、四次構造を予測することができる。 この場合、ヘモグロビンは[[heme/ja|ヘムユニットを含む]] {{Main/ja|Protein structure prediction/ja|List of protein structure prediction software/ja}}" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 10:1010:10, 25 February 2024 Fire talk contribs 70,251 bytes +270 Created page with "構造ゲノミクスの分野を補完するものとして、''タンパク質構造予測''は、タンパク質の効率的な数学モデルを開発し、実験室での観察によって構造を検出する代わりに、理論的に分子形成を計算で予測する。相同性モデリングとして知られる構造予測の最も成功したタイプは、モデル化されるタンパク質と配列が..." Tags: Mobile edit Mobile web edit

24 February 2024

  • curprev 23:0723:07, 24 February 2024 Fire talk contribs 69,981 bytes +40 Created page with "===細胞コンパートメント=== thumb|right|upright=1.35|異なる[[cellular compartment/ja|細胞コンパートメントのタンパク質と、緑色蛍光タンパク質でタグ付けされた構造（ここでは白）。]]"
  • curprev 22:5822:58, 24 February 2024 Fire talk contribs 69,941 bytes +165 Created page with "天然のタンパク質の場合、実験室での使用に十分な純度のタンパク質を得るためには、一連の精製工程が必要になることがある。このプロセスを簡略化するために、遺伝子工学はしばしば、タンパク質の構造や活性に影響を与えずに精製を容易にする化学的特徴をタンパク質に付加するために用いられる。この場合、特定のアミノ酸..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 22:5322:53, 24 February 2024 Fire talk contribs 69,776 bytes +376 Created page with "===タンパク質の精製=== {{Main/ja|Protein purification/ja}} ''試験管内''分析を行うには、タンパク質を他の細胞成分から分離して精製する必要がある。このプロセスは通常細胞溶解から始まり、細胞膜が破壊され、粗溶解液として知られる溶液中に細胞内内容物が放出される。得られた混合物はultracentrifugation/ja|超遠心分..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 22:4522:45, 24 February 2024 Fire talk contribs 69,400 bytes +458 Created page with "===バイオインフォマティクス=== {{Main/ja|Bioinformatics/ja}} タンパク質の構造、機能、進化を解析するために、膨大な数の計算手法が開発されてきた。このようなツールの開発は、ヒトゲノムを含む様々な生物について利用可能な大量のゲノムおよびプロテオミクスデータによって推進されてきた。すべてのタンパク質を実験的に研究すること..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 22:3522:35, 24 February 2024 Fire talk contribs 68,942 bytes +179 Created page with "==研究方法== {{Anchor|Methods of study}} {{Main/ja|Protein methods/ja}} タンパク質の活性と構造は、''試験管内''、''生体内''、''シリコンウェハ内''で調べることができる。精製したタンパク質を制御された環境で'''''試験管内'''''で培養する研究は、タンパク質がどのように機能を発揮するかを知る上で有用である：例えば、enzyme kin..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 22:2622:26, 24 February 2024 Fire talk contribs 68,763 bytes +628 Created page with "== タンパク質の進化 == {{Anchor|Protein evolution}} {{Main/ja|Molecular evolution/ja}} 分子生物学における重要な疑問は、タンパク質がどのように進化するのか、すなわちどのようにして突然変異（というよりアミノ酸配列の変化）が新しい構造や機能をもたらすのか、ということである。タンパク質中のほとんどのアミノ酸は、活性や機能を..."
  • curprev 22:1722:17, 24 February 2024 Fire talk contribs 68,135 bytes +1 No edit summary Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 22:1722:17, 24 February 2024 Fire talk contribs 68,134 bytes +116 Created page with "構造的機能を果たす他のタンパク質としては、ミオシン、キネシン、ダイニンなどのモータータンパク質があり、これらは機械的な力を発生させることができる。これらのタンパク質は、単細胞生物の細胞運動性や、有性生殖を行う多くの多細胞生物の精子に..."
  • curprev 22:1422:14, 24 February 2024 Fire talk contribs 68,018 bytes +293 Created page with "構造タンパク質は、本来は流動的な生体構成要素に硬さと剛性を与える。ほとんどの構造タンパク質は線維状タンパク質であり、例えばコラーゲンやエラスチンは結合組織、例えば軟骨の重要な構成要素であり、ケラチンは髪、爪、feather/ja|羽..."
  • curprev 22:0922:09, 24 February 2024 Fire talk contribs 67,725 bytes +256 Created page with "より複雑な計算問題は、分子ドッキング、タンパク質フォールディング、タンパク質間相互作用、化学反応性などの分子間相互作用の予測である。これらの動的過程をシミュレートする数理モデルには、分子力学、特に分子動力学が関与している。こ..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 22:0422:04, 24 February 2024 Fire talk contribs 67,469 bytes +252 Created page with "古典的な分子動力学にとどまらず、量子動力学手法を用いれば、量子力学的効果を正確に記述した上で、原子レベルの詳細なタンパク質のシミュレーションを行うことができる。例えば、多層多構成時間依存ハートリー（MCTDH）法や階層的運動方程式（HEOM）アプロー..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 21:5921:59, 24 February 2024 Fire talk contribs 67,217 bytes +26 Created page with "有機物の総窒素含有量は主にタンパク質中のアミノ基によって形成される。総ケルダール窒素（TKN）は、（廃）水、土壌、食品、飼料、および一般的には有機物の分析で広く使用される窒素の指標である。その名前が示すように、Kjeldahl法が適用される。より感度の高い方法も利用可能である。"
  • curprev 21:5521:55, 24 February 2024 Fire talk contribs 67,191 bytes +150 Created page with "==栄養== {{Anchor|Nutrition}} {{further/ja|Protein (nutrient)/ja|Protein quality/ja}} ほとんどの微生物と植物は20種類すべての標準的なアミノ酸を生合成することができるが、動物（ヒトを含む）はアミノ酸の一部を食事から摂取しなければならない。生物が自力で合成できないアミノ酸は必須アミノ酸..."
  • curprev 21:4921:49, 24 February 2024 Fire talk contribs 67,041 bytes +44 Created page with "膜貫通タンパク質は、小分子やイオンに対する細胞膜の透過性を変化させるリガンド輸送タンパク質としても機能する。膜だけでは疎水性コアがあり、そこを極性分子や荷電分子は拡散できない。膜タンパク質は、そのような分子が細胞内に出入り..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 21:4721:47, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,997 bytes +97 Created page with "多くのリガンド輸送タンパク質は、特定の|低分子生体分子と結合し、多細胞生物の体内の別の場所に輸送する。これらのタンパク質は、リガンドが高濃度で存在するときには高い結合親和性を持たなければならないが、標的組織中に低濃度で存在するときにはリガンドを放出しなければならない。リガンド結合タンパク質の典..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 21:4221:42, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,900 bytes −1 Created page with "抗体は適応免疫系のタンパク質成分であり、その主な機能は抗原、すなわち体内の異物と結合し、破壊の対象とすることである。抗体は細胞外環境に分泌されるか、形質細胞として知られる特殊なB細胞の膜に固定される。酵素が反応を行う必要性から基質との結合親和性..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 21:3821:38, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,901 bytes +196 Created page with "多くのタンパク質が細胞シグナル伝達やシグナル伝達の過程に関与している。インスリンのようないくつかのタンパク質は、それが合成された細胞から離れた組織の他の細胞にシグナルを伝達する細胞外タンパク質である。他のものは膜タンパク質で、receptor (biochemistr..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 15:2315:23, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,705 bytes +20 Created page with "===細胞シグナル伝達とリガンド結合=== {{See also/ja|Glycan-protein interactions/ja}} thumb|upright|[[carbohydrate/ja|炭水化物抗原に結合するコレラに対するマウス抗体のリボン図である。]]" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 15:1615:16, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,685 bytes +7 Created page with "ディリゲントタンパク質は、他の酵素によって合成された化合物の立体化学を決定するタンパク質の一種である。" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 15:1415:14, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,678 bytes −101 Created page with "酵素が結合し作用する分子はSubstrate (biochemistry)/ja基質と呼ばれる。酵素は何百ものアミノ酸から構成されることがあるが、通常、基質と接触する残基はごく一部であり、触媒反応に直接関与する残基はさらにごく一部である。 基質と結合し、触媒残基を含む酵素の領域は活性部位として知られている。"
  • curprev 15:1015:10, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,779 bytes +203 Created page with "===酵素=== {{Main/ja|Enzyme/ja}} 細胞内におけるタンパク質の最もよく知られた役割は、化学反応を触媒する酵素としての役割である。酵素は通常、非常に特異的であり、1つまたは少数の化学反応のみを促進する。酵素は代謝に関わる反応のほとんどを行うだけでなく、DNA複製、DNA修復、trans..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 15:0715:07, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,576 bytes +303 Created page with "タンパク質は低分子基質だけでなく、他のタンパク質とも結合することができる。タンパク質が同じ分子の他のコピーと特異的に結合すると、オリゴマー化して線維を形成することができる。この過程は、自己会合して硬い線維を形成する球状モノマーからなる構造タンパク質でしばしば起こる。Protein–protein interaction/ja|タ..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 15:0515:05, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,273 bytes −105 Created page with "タンパク質の最大の特徴は、他の分子と特異的かつ強固に結合できることである。他の分子と結合するタンパク質の領域は結合部位と呼ばれ、多くの場合、分子表面の窪みや「ポケット」である。この結合能力は、結合部位ポケットを規定するタンパク質の三次構造と、周囲のアミノ酸側鎖の化学的性質によって媒介される。例えば、rib..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:5714:57, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,378 bytes +186 Created page with "動物では、アミノ酸はタンパク質を含む食物を摂取することで得られる。摂取されたタンパク質は消化によってアミノ酸に分解されるが、この消化には通常、酸にさらされることによるタンパク質の変性と、プロテアーゼと呼ばれる酵素による加水分解が含まれる。摂取されたア..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:5314:53, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,192 bytes −47 Created page with "犬や猫などの動物では、タンパク質は毛包の成長と角化を促進することで皮膚の健康と質を維持し、悪臭を発生させる皮膚トラブルの可能性を減らす。質の悪いタンパク質は胃腸の健康にも関与し、犬の鼓腸や悪臭の可能性を高める。タンパク質が未消化の状態で大腸に到達すると、発酵して硫化水素ガス、インドール、スカトールが発生するからだ。..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:5114:51, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,239 bytes −7 Created page with "thumb|right|酵素[[hexokinase/ja|ヘキソキナーゼは、従来のボールと棒の分子モデルとして示されている。右上にあるのは、その基質であるATPとグルコースである。]]" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:4814:48, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,246 bytes +51 Created page with "タンパク質は細胞内の主役であり、遺伝子にコードされた情報によって指定された任務を遂行していると言われている。ある種のRNAを除いて、他のほとんどの生体分子はタンパク質が作用する比較的不活性な要素である。タンパク質は、''大腸菌''細胞の乾燥重量の半分を占めるが、DNAやRNAのような他の高分子はそれぞれ3%と20%に過ぎ..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:4014:40, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,195 bytes +66 Created page with "===タンパク質のトポロジー タンパク質のトポロジーは、骨格のもつれや折り畳まれた鎖内の接点の配置を記述する。タンパク質のトポロジーを特徴付けるために、結び目理論と回路トポロジーの2つの理論的枠組みが適用されている。タンパク質のトポロジーを記述できるようになることで、タンパク質工学や医薬品開..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:3814:38, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,129 bytes +119 Created page with "=== 配列モチーフ === タンパク質内の短いアミノ酸配列は、しばしば他のタンパク質の認識部位として働く。例えば、SH3ドメインは通常、短いPxxPモチーフ（すなわち、2つのプロリン［P］と2つの不特定のアミノ酸［x］で隔てられているが、周囲のアミノ酸が正確な結合特異性を決定するかもしれない）に結合する。..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 14:3614:36, 24 February 2024 Fire talk contribs 66,010 bytes +46 Created page with "=== タンパク質ドメイン === {{Main/ja|Protein domain/ja}} 多くのタンパク質はいくつかのタンパク質ドメインから構成されている。ドメインは通常、酵素的活性（例えば、キナーゼ）などの特定の機能も持つか、結合モジュール（例えば、SH3ドメインは他のタンパク質のプロリンに富んだ配列に結合する）とし..." Tags: Mobile edit Mobile web edit

23 February 2024

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