Amino acid/ja: Difference between revisions

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==== 特別な場合の側鎖 ====

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いくつかの側鎖は、荷電性、極性、疎水性のカテゴリーではうまく説明できない。[[Glycine/ja|グリシン]]（Gly, G）は、そのサイズが小さいため、アミノ基とカルボキシレート基によって溶解度が大きく左右されることから、極性アミノ酸と考えられる。しかし、グリシンには側鎖がないため、アミノ酸の中でも独特の柔軟性があり、タンパク質のフォールディングに大きな影響を与える。[[Cysteine/ja|システイン]]（Cys, C）も水素結合を形成しやすく、極性アミノ酸のカテゴリーに入るが、タンパク質構造中ではしばしば他のシステインと[[disulphide bonds/ja|ジスルフィド結合]]と呼ばれる共有結合を形成している。これらの結合はタンパク質の折り畳みと安定性に影響を与え、[[Antibody/ja#Structure|抗体]]の形成に不可欠である。[[Proline/ja|プロリン]]（Pro, P）はアルキル側鎖を持ち、疎水性であると考えられるが、側鎖がαアミノ基に結合しているため、タンパク質に取り込まれると特に柔軟性がなくなる。グリシンと同様に、これはアミノ酸の中でもユニークな方法でタンパク質の構造に影響を与える。[[Selenocysteine/ja|セレノシステイン]]（Sec, U）はDNAに直接コードされていないが、リボソームを介してタンパク質に組み込まれる珍しいアミノ酸である。セレノシステインは同様のシステインに比べて酸化還元電位が低く、いくつかのユニークな酵素反応に関与している。[[Pyrrolysine/ja|ピロリジン]]（Pyl, O）はDNAにコードされていない別のアミノ酸であるが、リボソームによってタンパク質に合成される。古細菌種に存在し、いくつかのメチルトランスフェラーゼの触媒活性に関与している。

~~Several side chains are not described well by the charged, polar and hydrophobic categories.~~ [[Glycine]] ~~(Gly, G) could be considered a polar amino acid since its small size means that its solubility is largely determined by the amino and carboxylate groups. However~~, ~~the lack of any side chain provides glycine with a unique flexibility among amino acids with large ramifications to protein folding.~~ [[Cysteine]] ~~(Cys, C) can also form hydrogen bonds readily~~, ~~which would place it in the polar amino acid category, though it can often be found in protein structures forming covalent bonds, called~~ [[disulphide bonds]]~~, with other cysteines. These bonds influence the folding and stability of proteins, and are essential in the formation of~~ [[Antibody#Structure|~~antibodies~~]]. [[Proline]] ~~(Pro~~, P) has an alkyl side chain and could be considered hydrophobic, but because the side chain joins back onto the alpha amino group it becomes particularly inflexible when incorporated into proteins. Similar to glycine this influences protein structure in a way unique among amino acids. [[Selenocysteine]] ~~(Sec, U) is a rare amino acid not directly encoded by DNA, but is incorporated into proteins via the ribosome. Selenocysteine has a lower redox potential compared to the similar cysteine~~, ~~and participates in several unique enzymatic reactions.~~ [[Pyrrolysine]] ~~(Pyl~~, ~~O) is another amino acid not encoded in DNA, but synthesized into protein by ribosomes. It is found in archaeal species where it participates in the catalytic activity of several methyltransferases.~~

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 ==== 特別な場合の側鎖 ====
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+いくつかの側鎖は、荷電性、極性、疎水性のカテゴリーではうまく説明できない。[[Glycine/ja|グリシン]]（Gly, G）は、そのサイズが小さいため、アミノ基とカルボキシレート基によって溶解度が大きく左右されることから、極性アミノ酸と考えられる。しかし、グリシンには側鎖がないため、アミノ酸の中でも独特の柔軟性があり、タンパク質のフォールディングに大きな影響を与える。[[Cysteine/ja|システイン]]（Cys, C）も水素結合を形成しやすく、極性アミノ酸のカテゴリーに入るが、タンパク質構造中ではしばしば他のシステインと[[disulphide bonds/ja|ジスルフィド結合]]と呼ばれる共有結合を形成している。これらの結合はタンパク質の折り畳みと安定性に影響を与え、[[Antibody/ja#Structure|抗体]]の形成に不可欠である。[[Proline/ja|プロリン]]（Pro, P）はアルキル側鎖を持ち、疎水性であると考えられるが、側鎖がαアミノ基に結合しているため、タンパク質に取り込まれると特に柔軟性がなくなる。グリシンと同様に、これはアミノ酸の中でもユニークな方法でタンパク質の構造に影響を与える。[[Selenocysteine/ja|セレノシステイン]]（Sec, U）はDNAに直接コードされていないが、リボソームを介してタンパク質に組み込まれる珍しいアミノ酸である。セレノシステインは同様のシステインに比べて酸化還元電位が低く、いくつかのユニークな酵素反応に関与している。[[Pyrrolysine/ja|ピロリジン]]（Pyl, O）はDNAにコードされていない別のアミノ酸であるが、リボソームによってタンパク質に合成される。古細菌種に存在し、いくつかのメチルトランスフェラーゼの触媒活性に関与している。
-Several side chains are not described well by the charged, polar and hydrophobic categories. [[Glycine]] (Gly, G) could be considered a polar amino acid since its small size means that its solubility is largely determined by the amino and carboxylate groups. However, the lack of any side chain provides glycine with a unique flexibility among amino acids with large ramifications to protein folding. [[Cysteine]] (Cys, C) can also form hydrogen bonds readily, which would place it in the polar amino acid category, though it can often be found in protein structures forming covalent bonds, called [[disulphide bonds]], with other cysteines. These bonds influence the folding and stability of proteins, and are essential in the formation of [[Antibody#Structure|antibodies]]. [[Proline]] (Pro, P) has an alkyl side chain and could be considered hydrophobic, but because the side chain joins back onto the alpha amino group it becomes particularly inflexible when incorporated into proteins. Similar to glycine this influences protein structure in a way unique among amino acids. [[Selenocysteine]] (Sec, U) is a rare amino acid not directly encoded by DNA, but is incorporated into proteins via the ribosome. Selenocysteine has a lower redox potential compared to the similar cysteine, and participates in several unique enzymatic reactions. [[Pyrrolysine]] (Pyl, O) is another amino acid not encoded in DNA, but synthesized into protein by ribosomes. It is found in archaeal species where it participates in the catalytic activity of several methyltransferases.
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