Translations:Citric acid cycle/10/ja: Difference between revisions

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!基板
!基板
!酵素
!酵素
!製品
!生成物
!コメント
!コメント
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|[[Alpha-ketoglutarate dehydrogenase/ja|α-ケトグルタル酸<br />デヒドロゲナーゼ]], [[Thiamine pyrophosphate/ja]], [[Lipoic acid/ja]], Mg++,トランスサクシニターゼ
|[[Alpha-ketoglutarate dehydrogenase/ja|α-ケトグルタル酸<br />デヒドロゲナーゼ]], [[Thiamine pyrophosphate/ja]], [[Lipoic acid/ja]], Mg++,トランスサクシニターゼ
|[[Succinyl-CoA/ja]] + [[Nicotinamide adenine dinucleotide/ja|NADH + H <sup>+</sup>]] + CO<sub>2</sub>
|[[Succinyl-CoA/ja]] + [[Nicotinamide adenine dinucleotide/ja|NADH + H <sup>+</sup>]] + CO<sub>2</sub>
|不可逆的な段階で[[Nicotinamide adenine dinucleotide/ja|NADH]]を生成 (ATP2.5分）、4C鎖を再生する（CoAは除く）。
|不可逆的な段階で[[Nicotinamide adenine dinucleotide/ja|NADH]]を生成 （ATP2.5分）、4C鎖を再生する（CoAは除く）。
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Latest revision as of 19:45, 1 April 2024

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Message definition (Citric acid cycle)
== Steps ==
There are ten basic steps in the citric acid cycle, as outlined below. The cycle is continuously supplied with new carbon in the form of [[acetyl-CoA]], entering at step 0 in the table.
{| class="wikitable"
!
!Reaction type
!Substrates
!Enzyme
!Products
!Comment
|-
|{{nowrap|0 / 10}}
|[[Aldol condensation]]
|[[Oxaloacetic acid|Oxaloacetate]] + [[Acetyl CoA]] + H<sub>2</sub>O
|[[Citrate synthase]]
|[[Citric acid|Citrate]] + [[Coenzyme A|CoA-SH]]
|irreversible, extends the 4C [[Oxaloacetic acid|oxaloacetate]] to a 6C molecule
|-
|1
| [[Dehydration reaction|Dehydration]]
|[[Citrate]]
| rowspan="2" |[[Aconitase]]
|''[[Cis–trans isomerism|cis]]''-[[Aconitic acid|Aconitate]] + H<sub>2</sub>O
|rowspan=2|reversible [[Isomerization|isomerisation]]
|-
|2
|[[Hydration reaction|Hydration]]
|[[Aconitate|''cis''-Aconitate]] + H<sub>2</sub>O
|[[Isocitric acid|Isocitrate]]
|-
|3
|[[Oxidation]]
|[[Isocitrate]] + [[Nicotinamide adenine dinucleotide|NAD]]<sup>+</sup>
| rowspan="2" |[[Isocitrate dehydrogenase]]
|[[Oxalosuccinic acid|Oxalosuccinate]] + [[Nicotinamide adenine dinucleotide|NADH + H <sup>+</sup>]]
|generates [[NADH]] (equivalent of 2.5 ATP)
|-
|4
|[[Decarboxylation]]
|[[Oxalosuccinate]]
|[[alpha-Ketoglutaric acid|α-Ketoglutarate]] + CO<sub>2</sub>
|rate-limiting, irreversible stage, generates a 5C molecule
|-
|5
|Oxidative<br />[[decarboxylation]]
|[[alpha-Ketoglutaric acid|α-Ketoglutarate]] + NAD<sup>+</sup> + CoA-SH
|[[Alpha-ketoglutarate dehydrogenase|α-Ketoglutarate<br />dehydrogenase]], [[Thiamine pyrophosphate]], [[Lipoic acid]], Mg++,transsuccinytase
|[[Succinyl-CoA]] + [[Nicotinamide adenine dinucleotide|NADH + H <sup>+</sup>]] + CO<sub>2</sub>
|irreversible stage, generates [[Nicotinamide adenine dinucleotide|NADH]] (equivalent of 2.5 ATP), regenerates the 4C chain (CoA excluded)
|-
|6
|[[substrate-level phosphorylation|substrate-level<br />phosphorylation]]
|[[Succinyl-CoA]] + [[Guanosine diphosphate|GDP]] + [[Inorganic phosphate|P<sub>i</sub>]]
|[[Succinyl coenzyme A synthetase|Succinyl-CoA synthetase]]
|[[Succinic acid|Succinate]] + CoA-SH + [[Guanosine triphosphate|GTP]]
|or [[adenosine diphosphate|ADP]]→[[adenosine triphosphate|ATP]] instead of GDP→GTP, generates 1 ATP or equivalent.<br />[[Condensation reaction]] of [[Guanosine diphosphate|GDP]] + [[Inorganic phosphate|P<sub>i</sub>]] and [[hydrolysis]] of [[succinyl-CoA]] involve the H<sub>2</sub>O needed for balanced equation.
|-
|7
|[[Redox|Oxidation]]
|[[Succinate]] + [[ubiquinone]] (Q)
|[[Succinate dehydrogenase]]
|[[Fumaric acid|Fumarate]] + [[ubiquinol]] (QH<sub>2</sub>)
|uses [[Flavin adenine dinucleotide|FAD]] as a [[prosthetic group]] (FAD→FADH<sub>2</sub> in the first step of the reaction) in the enzyme.<br />These two electrons are later transferred to QH<sub>2</sub> during Complex II of the ETC, where they generate the equivalent of 1.5 ATP
|-
|8
|[[Hydration reaction|Hydration]]
|[[Fumarate]] + H<sub>2</sub>O
|[[Fumarase]]
|''L''-[[Malic acid|Malate]]
|Hydration of C-C double bond
|-
|9
|[[Redox|Oxidation]]
|[[Malate|<small>L</small>-Malate]] + NAD<sup>+</sup>
|[[Malate dehydrogenase]]
|[[Oxaloacetate]] + NADH + H<sup>+</sup>
|reversible (in fact, equilibrium favors malate), generates [[NADH]] (equivalent of 2.5 ATP)
|-
|10 / 0
|[[Aldol condensation]]
|[[Oxaloacetic acid|Oxaloacetate]] + [[Acetyl CoA]] + H<sub>2</sub>O
|[[Citrate synthase]]
|[[Citric acid|Citrate]] + [[Coenzyme A|CoA-SH]]
|This is the same as step 0 and restarts the cycle. The reaction is irreversible and extends the 4C oxaloacetate to a 6C molecule
|}

ステップ

クエン酸サイクルには、以下に概説する10の基本ステップがある。このサイクルには、表のステップ0から入るアセチル-CoAの形で新しい炭素が継続的に供給される。

反応タイプ 基板 酵素 生成物 コメント
0 / 10 Aldol condensation/ja オキサロ酢酸 + アセチルCoA + H2O Citrate synthase/ja クエン酸塩 + CoA-SH 不可逆的に、4Cのオキサロ酢酸を6Cの分子に拡張する
1 脱水症状 Citrate/ja Aconitase/ja cis-アコニット + H2O 可逆 異性化
2 水分補給 cis-アコニット + H2O イソクエン酸塩
3 Oxidation/ja Isocitrate/ja + NAD+ Isocitrate dehydrogenase/ja オキサロコハク酸塩 + NADH + H + NADH生成 (2.5ATPに相当する)
4 Decarboxylation/ja Oxalosuccinate/ja α-ケトグルタル酸 + CO2 律速段階となる不可逆的な段階では、5C分子が生成される。
5 酸化的
脱炭酸 		α-ケトグルタル酸 + NAD+ + CoA-SH α-ケトグルタル酸
デヒドロゲナーゼ, チアミンピロリン酸, Lipoic acid/ja, Mg++,トランスサクシニターゼ 		Succinyl-CoA/ja + NADH + H + + CO2 不可逆的な段階でNADHを生成 （ATP2.5分）、4C鎖を再生する（CoAは除く）。
6 基質レベルの
リン酸化 		Succinyl-CoA/ja + GDP + Pi スクシニル-CoA合成酵素 コハク酸塩 + CoA-SH + GTP あるいは、 GDP→GTPの代わりにADP→ATPで1ATP生成される。
GDP+Piの縮合反応とスクシニル-CoAの加水分解は平衡方程式に必要なH2Oを含む。
7 酸化 Succinate/ja + ubiquinone/ja (Q) Succinate dehydrogenase/ja フマル酸塩 + ubiquinol/ja (QH2) 酵素の補欠基としてFADを使用（反応の第一段階におけるFAD→FADH2）
この2つの電子は後にETCの複合体IIでQH2に移動し、そこで1.5ATPに相当する電子が生成される。
8 水分補給 Fumarate/ja + H2O Fumarase/ja L-リンゴ酸塩 C-C二重結合の水和
9 酸化 L-リンゴ酸塩 + NAD+ Malate dehydrogenase/ja Oxaloacetate/ja + NADH + H+ 可逆的（実際には平衡はリンゴ酸に有利）、NADHを生成する（2.5ATPに相当）
10 / 0 Aldol condensation/ja オキサロ酢酸 + Acetyl CoA + H2O Citrate synthase/ja クエン酸塩 + CoA-SH これはステップ0と同じで、サイクルを再開する。この反応は不可逆的で、4Cのオキサロ酢酸を6Cの分子に拡張する。
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