Pyridoxal phosphate/ja: Revision history

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Pyridoxal phosphate/ja
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4 April 2024

  • curprev 15:0215:02, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,874 bytes 0 No edit summary Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:2409:24, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,874 bytes +213 Created page with "==進化== {{Anchor|Evolution}} ピリドキサール-5-リン酸（ビタミンB6）依存性酵素には複数の進化的起源がある。全体のB6酵素は4つの独立した進化系統に分岐した：αファミリー（すなわちアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ）、βファミリー（セリンデヒドラターゼ）、D-alanin..."
  • curprev 09:2209:22, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,661 bytes +395 Created page with "阻害剤の例： * レボチロキシンは、肝臓のシステイン脱硫酵素活性を消失させる。D,L-チロキシンを毎日10 μgだけ15日間ラットに投与すると、肝臓のシステイン脱硫脱水酵素活性は消失し、セリン・スレオニン脱水酵素活性とアラニン・グルタミン酸トランスアミナーゼ活性は約40％低下する。生体内にピリドキサール-5-リン酸を与える..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:2009:20, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,266 bytes +56 Created page with "==阻害剤== {{Anchor|Inhibitors}} PLP酵素の阻害剤がいくつか知られている。" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1909:19, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,210 bytes +117 Created page with "===生物学的合成=== 中枢代謝、特にアミノ酸の生合成においてPLPが広く利用されていること、また酵素がない状態でも活性を示すことから、PLPは「プレバイオティック」化合物、すなわち有機生命体の起源よりも前に存在した化合物である可能性が示唆される（プレバイオティック化合物と混同しないように、有益なバクテリアの餌..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1909:19, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,093 bytes +57 Created page with "====DXP非依存的生合成==== DXP非依存的なPLP生合成経路は、2つのサブユニットからなる酵素、PLP-シンターゼによって触媒されるステップからなる。PdxSはリブロース5-リン酸、グリセルアルデヒド-3-リン酸、アンモニアの縮合を触媒し、この後者の分子はグルタミンからアンモニアの生成を触媒するPdxTによって生成される。PdxSは(β/α)..."
  • curprev 09:1809:18, 4 April 2024 Fire talk contribs 19,036 bytes +210 Created page with "''大腸菌''において、pdxB（エリスロン酸4リン酸脱水素酵素をコードする）の欠失によって引き起こされる補助栄養を抑制することができる「セレンディピタス経路」が過剰発現ライブラリーから発見された。セレンディピタス経路は非常に非効率的であったが、様々な酵素のプロミスキューティ活性のおかげで可能であった。この経..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1809:18, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,826 bytes −56 Created page with "700px|center" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1809:18, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,882 bytes +31 Created page with "最初の分岐は、''大腸菌''では''epd''、''pdxB''、''serC''および''pdxA''にコードされる酵素によって触媒される。これらは、セリン生合成の3つの酵素（''serA''（''pdxB''のホモログ）、''serC''、''serB''-ただし、''epd''は''gap''のホモログ）と機構的な類似性と相同性を共有しており、2つの経路の進化的起源を共有している。いくつかの生物種では、''大腸菌''の''serC''..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1709:17, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,851 bytes +320 Created page with "DXP依存的な生合成経路はいくつかの段階と2つの分岐の収束を必要とし、一方はエリスロース4-リン酸から3-ヒドロキシ-1-アミノアセトンリン酸を産生し、もう一方（単一酵素）はグリセルアルデヒド3-リン酸（GAP）とピルビン酸からdeoxyxylulose 5-phosphate/ja|デオキシ..."
  • curprev 09:1509:15, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,531 bytes −61 Created page with "====DXP依存の生合成===="
  • curprev 09:1509:15, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,592 bytes −61 Created page with "===プロトトロフィー=== 一方はデオキシルロース5リン酸（DXP）を必要とし、もう一方は必要としないため、DXP依存性およびDXP非依存性と呼ばれている。これらの経路は、それぞれ''大腸菌''と''枯草菌''で広く研究されてきた。出発化合物が異なり、必要な工程数が異なるにもかかわらず、この2つの経路には多くの共通点がある。" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1509:15, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,653 bytes +71 Created page with "===ビタミンBから=== 動物はこの酵素補酵素のアホトロフィーであり、補うためにはそれか中間体を必要とする。そのため、例えばMoCoやCoQ10とは異なり、ビタミンB<sub>6</sub>として分類される。PLPは、酵素ピリドキサールキナーゼによってピリドキサールから合成され、1個のATP分子を必要とする。PLP..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1409:14, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,582 bytes +300 Created page with "==PLP-酵素== {{Anchor|PLP-enzymes}} PLPは、リジンだけでなく、リン酸基とリン酸結合ポケットとの相互作用によって活性部位に保持され、さらに、ピリジン環と張り出した芳香族残基、一般的にはチロシン（チロシンも酸塩基触媒反応に関与することがある）との塩基のスタッキングによって、活性部位に保持される。PLP結合ポケットの要件は限られているに..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1409:14, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,282 bytes −35 Created page with "==生合成== {{Anchor|Biosynthesis}}" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1209:12, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,317 bytes +77 Created page with "==特異性== {{Anchor|Specificity}} 特異性は、アミノ酸アルジミン状態のα-炭素の4つの結合のうち、ピリジン環に垂直な結合が切断されるという事実によって与えられる（デュナサン立体電子仮説）。その結果、特異性は酵素が基質とどのように結合するかによって決まる。 特異性においてさらに重要な役割を果たすのが、pyr..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1109:11, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,240 bytes −38 Created page with "ピリドキサール-5′-リン酸依存性酵素（PLP酵素）は無数の反応を触媒する。PLPが触媒する反応の範囲は膨大に見えるが、統一的な原理は、内部のリジン由来のアルジミンの形成である。アミノ基質が活性部位と相互作用すると、一般に外部アルジミンと呼ばれる新しいシッフ塩基が生成する。このステップの後、それぞれのPLP触媒反応の経路は分岐する..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1009:10, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,278 bytes +179 Created page with "大多数のPLP依存性酵素は、活性部位のリジン残基を介してPLPと内部アルジミンを形成するが、一部のPLP依存性酵素はこのリジン残基を持たず、代わりに活性部位にヒスチジンを持つ。このような場合、ヒスチジンは内部アルジミンを形成することができないため、補酵素は酵素に共有結合しない。ColD/ja|GDP-4-ケト-6-デオキシマンノース-3-デヒドラターゼ..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:1009:10, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,099 bytes +118 Created page with "==PLPの非古典的な例== {{Anchor|Non-classical examples of PLP}} PLPは肝臓のグリコーゲンホスホリラーゼ上にも存在し、グルカゴンやエピネフリンのシグナルを受けてグリコーゲン分解でグリコーゲンを分解するのに使われる。しかし、この酵素は反応性のアルデヒド基を利用せず、代わ..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:0809:08, 4 April 2024 Fire talk contribs 17,981 bytes +349 No edit summary Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:0509:05, 4 April 2024 Fire talk contribs 17,632 bytes −490 Created page with "ピリドキサールリン酸は人体内で数多くの役割を担っている。以下にいくつか例を挙げる： * '''セロトニンの代謝と生合成''' ピリドキサールリン酸は芳香族L-アミノ酸脱炭酸酵素の補要素である。これにより、[[5-Hydroxytryptophan/ja|5-ヒドロキシトリプトファン]..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:0109:01, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,122 bytes −14 Created page with "== 人体における役割== {{Anchor|Role in human body}} {{Main/ja|Vitamin B6/ja}}" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:0109:01, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,136 bytes +25 Created page with "PLPは、レボドパからドーパミンへの変換に関与し、興奮性神経伝達物質であるグルタミン酸から抑制性神経伝達物質であるGABAへの変換を促進し、SAMを脱炭酸させてポリアミンの前駆体であるプロピルアミンを形成させる。" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:0009:00, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,111 bytes −44 Created page with "また、ヘム合成における縮合反応でも活性を示す。" Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 09:0009:00, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,155 bytes −4 Created page with "PLPは、セリンデヒドラターゼやGDP-4-ケト-6-デオキシマンノース-3-デヒドラターゼ（ColD）が行う反応など、様々なβ-脱離反応にも関与している。"
  • curprev 09:0009:00, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,159 bytes +145 Created page with "トランスアミノ化では、脱プロトン化後にキノノイド中間体が別の位置でプロトンを受け入れ、ケチミンとなる。得られたケチミンは加水分解され、アミノ基が複合体上に残る。さらに、PLPはペルオサミンやデソサミンのような珍しい糖に作用するアミノトランスフェラーゼ（またはトランスアミナーゼ）によって..." Tags: Mobile edit Mobile web edit
  • curprev 08:5908:59, 4 April 2024 Fire talk contribs 18,014 bytes +182 Created page with "==補酵素としての役割== {{Anchor|Role as a coenzyme}} PLPはすべてのトランスアミノ化反応、および特定の脱炭酸、脱アミノ化、アミノ酸のラセミ化反応において補酵素として働く。 PLPのアルデヒド基は、アミノトランスフェラーゼ酵素の特定のリジン基のε-アミノ基..." Tags: Mobile edit Mobile web edit

3 April 2024

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