酵素は化学工業やその他の産業用途で、極めて特異的な触媒が必要とされる場合に用いられる。一般に酵素は、触媒するために進化してきた反応の数に限界があり、また有機溶媒中や高温での安定性に欠ける。その結果、タンパク質工学は活発な研究分野であり、合理的な設計や試験管内進化によって、新しい性質を持つ新しい酵素を作り出す試みが行われている。このような努力は成功を収め始めており、現在では、自然界では起こらない反応を触媒する酵素が「ゼロから」設計されている。