多くの非必須アミノ酸の炭素骨格はクエン酸サイクル中間体から作られる。それらをアミノ酸に変えるためには、クエン酸サイクル中間体から形成されたαケト酸が、ピリドキサールリン酸を補酵素とするトランスアミノ化反応で、グルタミン酸からアミノ基を獲得しなければならない。この反応でグルタミン酸はクエン酸サイクルの中間体であるα-ケトグルタル酸に変換される。アミノ酸合成のための炭素骨格を提供できる中間体は、アスパラギン酸とアスパラギンを形成するオキサロ酢酸と、グルタミン、プロリン、アルギニンを形成する。