体内には、トリプトファン、collagen/jaコラーゲン、FAD、NADH、ポルフィリンなど、固有の蛍光を持つ分子が数多く存在する。 科学者たちはこれを利用して、病気の進行や治療効果をモニターしたり、診断に役立てたりしている。 例えば、FADとNADHのネイティブ蛍光は正常組織と口腔粘膜下線維症で異なる。これは浸潤性口腔癌の初期徴候である。そのため医師は、標準的な生検とは対照的に、診断の補助や治療のモニタリングに蛍光を採用している。