プロバイオティクスが牛乳アレルギーの治療に有用であることを示すエビデンスは、限られた質の低いものしか存在しない。2015年のレビューでは、湿疹のある乳児に直接プロバイオティクスを与えたり、母親が妊娠後期および母乳育児中にプロバイオティクスを使用した乳児では、湿疹のリスクが低いという質の低いエビデンスが示された。