Latest revision as of 11:29, 29 March 2024
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Message definition (Amino acid ) ==Physicochemical properties== The 20 canonical amino acids can be classified according to their properties. Important factors are charge, [[hydrophilicity]] or [[hydrophobicity]], size, and functional groups. These properties influence [[protein structure]] and [[protein–protein interaction]]s. The water-soluble proteins tend to have their hydrophobic residues ([[leucine|Leu]], [[isoleucine|Ile]], [[valine|Val]], [[phenylalanine|Phe]], and [[tryptophan|Trp]]) buried in the middle of the protein, whereas hydrophilic side chains are exposed to the aqueous solvent. (In [[biochemistry]], a residue refers to a specific [[monomer]] ''within'' the [[polymer]]ic chain of a [[polysaccharide]], protein or [[nucleic acid]].) The [[integral membrane protein]]s tend to have outer rings of exposed [[hydrophobic]] amino acids that anchor them in the [[lipid bilayer]]. Some [[peripheral membrane protein]]s have a patch of hydrophobic amino acids on their surface that sticks to the membrane. In a similar fashion, proteins that have to bind to positively charged molecules have surfaces rich in negatively charged amino acids such as [[glutamate]] and [[aspartate]], while proteins binding to negatively charged molecules have surfaces rich in positively charged amino acids like [[lysine]] and [[arginine]]. For example, lysine and arginine are present in large amounts in the [[Low complexity regions in proteins|low-complexity regions]] of nucleic-acid binding proteins. There are various [[hydrophobicity scale]]s of amino acid residues.
物理化学的性質
20種類のアミノ酸は、その性質によって分類することができる。重要な要素は、電荷、親水性 または疎水性 、サイズ、および官能基である。これらの特性はタンパク質構造 やタンパク質間相互作用 に影響を与える。水溶性タンパク質は疎水性残基(Leu 、Ile 、Val 、Phe 、Trp )がタンパク質の中央部に埋もれ、親水性側鎖が水溶媒に露出する傾向がある。生化学 では、残基は多糖 、タンパク質、核酸 のポリマー 鎖内の特定のモノマー を指す)。積分膜タンパク質 は、脂質二重層 に固定するために、露出した疎水性 アミノ酸の外側の環を持つ傾向がある。一部の周辺膜タンパク質 は表面に疎水性アミノ酸のパッチを持ち、それが膜に付着している。同様に、正電荷を帯びた分子と結合しなければならないタンパク質は、グルタミン酸 やアスパラギン酸 のような負電荷を帯びたアミノ酸を表面に多く持ち、負電荷を帯びた分子と結合するタンパク質は、リジン やアルギニン のような正電荷を帯びたアミノ酸を表面に多く持つ。例えば、リジンとアルギニンは核酸結合タンパク質のタンパク質の低複雑性領域 に大量に存在する。アミノ酸残基の疎水性スケール には様々なものがある。