Latest revision as of 08:27, 22 February 2024
酵素はいくつかの方法で反応を促進することができるが、そのどれもが活性化エネルギー（ΔG‡、ギブス自由エネルギー）を低下させる。
- 遷移状態を安定化させる：
- 遷移状態と相補的な電荷分布を持つ環境を作り、エネルギーを下げる。
- 代替反応経路を提供する：
- 基質と一時的に反応して共有結合中間体を形成し、より低エネルギーの遷移状態を提供する。
- 基質の基底状態を不安定化する：
- 結合した基質を遷移状態の形に変形させ、遷移状態に到達するのに必要なエネルギーを低下させる。
- 基質を生産的な配置に配向させ、反応のエントロピー変化を減少させる（この機構の触媒反応への寄与は比較的小さい）。
酵素はこれらの機構のいくつかを同時に用いることがある。例えば、トリプシンのようなプロテアーゼは、触媒三重鎖を用いて共有結合触媒反応を行い、オキシアニオンホールを用いて遷移状態の電荷蓄積を安定化させ、配向した水基質を用いて加水分解を完了させる。