多くのリガンド輸送タンパク質は、特定の|低分子生体分子と結合し、多細胞生物の体内の別の場所に輸送する。これらのタンパク質は、リガンドが高濃度で存在するときには高い結合親和性を持たなければならないが、標的組織中に低濃度で存在するときにはリガンドを放出しなければならない。リガンド結合タンパク質の典型例はヘモグロビンであり、すべての脊椎動物の肺から他の臓器や組織に酸素を輸送する。レクチンは糖結合タンパク質であり、その糖鎖部分に非常に特異的である。レクチンは通常、細胞やタンパク質が関与する生物学的な認識現象において役割を果たす。受容体やホルモンは特異性の高い結合タンパク質である。