浮き袋と、後には骨化した内骨格をもつことによって区別される硬骨魚類は、デボン紀末の大量絶滅で板皮類という頂点捕食者が消滅した後、優勢な魚類群となった。硬骨魚類はさらに肉鰭類と条鰭類に分けられる。現生魚類の約96%は真骨類であり、これは冠群に属する条鰭類で、顎を前方に突き出すことができる。四肢動物は、主として陸生のクレードであり、後期古生代以降、水界および陸界双方の食物連鎖上位を支配してきたが、これらは石炭紀に肉鰭類から進化し、肺を獲得した。肺は浮き袋と相同である。系統分類学的には四肢動物は魚類に含まれるが、通常は魚類とは見なされない。