プログルカゴン遺伝子は、膵臓（ランゲルハンス島のα細胞）、腸（腸内分泌L細胞）および脳（尾側脳幹および視床下部）を含むいくつかの臓器で発現している。膵プログルカゴン遺伝子の発現は、空腹時および低血糖誘導時に促進され、インスリンによって抑制される。逆に、腸のプログルカゴン遺伝子発現は空腹時には減少し、食物摂取により刺激される。哺乳類では、転写は3つの細胞型すべてで同一のmRNAを生じ、さらにプログルカゴンと呼ばれる180アミノ酸の前駆体に翻訳される。しかし、組織特異的な翻訳後プロセシング機構の結果、異なる細胞では異なるペプチドが産生される。