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プロテオミクス
このような大規模なデータセットの研究は、プロテオミクスの分野を定義しており、ゲノミクスの関連分野との類似から名付けられた。プロテオミクスの主要な実験技術には、多くのタンパク質の分離を可能にする2D電気泳動、タンパク質の迅速なハイスループット同定とペプチドの配列決定（多くの場合ゲル内消化の後）を可能にする質量分析などがある、 タンパク質マイクロアレイは、細胞内に存在する様々なタンパク質の相対レベルの検出を可能にし、ツーハイブリッドスクリーニングは、タンパク質-タンパク質相互作用の系統的な探索を可能にする。生物学的に可能なこのような相互作用の総体はインタラクトームとして知られている。あらゆる可能性のあるフォールドを代表するタンパク質の構造を決定する体系的な試みは、構造ゲノム学として知られている。