タンパク質は、超遠心分離、沈殿、電気泳動、クロマトグラフィーなどの様々な技術を用いて、他の細胞成分から精製することができる。タンパク質の構造と機能を研究するために一般的に用いられる方法には、免疫組織化学、部位特異的突然変異誘発、X線結晶構造解析、核磁気共鳴、質量分析などがある。