5つのアミノ酸は中性pHで電荷を持つ。多くの場合、これらの側鎖はタンパク質の表面に現れ、水への溶解を可能にする。反対の電荷を持つ側鎖は、塩橋と呼ばれる重要な静電的接触を形成し、1つのタンパク質内または相互作用するタンパク質間の構造を維持する。多くのタンパク質は金属を特異的にその構造に結合させ、これらの相互作用は一般的にアスパラギン酸、グルタミン酸、ヒスチジンなどの荷電側鎖によって媒介される。特定の条件下では、それぞれのイオン形成基が帯電し、二重塩を形成することがある。