Thiamine pyrophosphate/ja: Difference between revisions

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Thiamine pyrophosphate/ja
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化学的には、TPPは[[pyrimidine/ja|ピリミジン]]環から成り、その環は[[thiazole/ja|チアゾール]]環に接続され、さらにその環は[[pyrophosphate/ja|ピロリン酸]](第二リン酸)[[functional group/ja|官能基]]に接続されている。
化学的には、TPPは[[pyrimidine/ja|ピリミジン]]環から成り、その環は[[thiazole/ja|チアゾール]]環に接続され、さらにその環は[[pyrophosphate/ja|ピロリン酸]](第二リン酸)[[functional group/ja|官能基]]に接続されている。


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TPP分子で最もよく反応に関与する部分は、[[nitrogen/ja|窒素]][[sulfur/ja|硫黄]]を含むチアゾール環である。したがって、チアゾール環は分子の「試薬部分」である。この環のC2は、その[[proton/ja|プロトン]]を供与して[[carbanion/ja|カルバニオン]]を形成することで、[[acid/ja|酸]]として作用することができる。通常、カルバニオンを形成する反応は非常に不利であるが、カルバニオンのすぐ隣の4価の窒素上の正電荷が負電荷を安定化させ、反応をより有利にする。隣接する原子に正と負の電荷を持つ化合物は[[ylide/ja|イリド]]と呼ばれるので、TPPのカルバニオン型を「イリド型」と呼ぶこともある。
The part of TPP molecule that is most commonly involved in reactions is the thiazole ring, which contains [[nitrogen]] and [[sulfur]]. Thus, the thiazole ring is the "reagent portion" of the molecule. The C2 of this ring is capable of acting as an [[acid]] by donating its [[proton]] and forming a [[carbanion]]. Normally, reactions that form carbanions are highly unfavorable, but the positive charge on the tetravalent nitrogen just adjacent to the carbanion stabilizes the negative charge, making the reaction much more favorable. A compound with positive and negative charges on adjacent atoms is called an [[ylide]], so sometimes the carbanion form of TPP is referred to as the "ylide form".
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Revision as of 15:04, 10 April 2024

Thiamine pyrophosphate/ja
Names
IUPAC name
2-[3-[(4-amino-2-methylpyrimidin-5-yl)methyl]-4-methyl-1,3-thiazol-3-ium-5-yl]ethyl phosphono hydrogen phosphate
Other names
Thiamine diphosphate
Identifiers
3D model (JSmol)
ChEBI
ChemSpider
KEGG
MeSH Thiamine+pyrophosphate
UNII
Properties
C12H19N4O7P2S+
Molar mass 425.314382 g/mol

チアミンピロリン酸TPPまたはThPP)、またはチアミン二リン酸ThDP)、またはコカルボキシラーゼは、酵素によって生成されるチアミン(ビタミンB1)の誘導体である。[チアミンジホスホキナーゼ]]によって生成される。チアミン・ピロリン酸は補因子であり、すべての生体系に存在し、いくつかの生化学反応を触媒する。

チアミンピロリン酸は細胞質で合成され、細胞質ではトランスケトラーゼの活性に、ミトコンドリアではピルビン酸、オキソグルタル酸、分岐鎖ケト酸デヒドロゲナーゼの活性に必要である。現在までに、ThPPとThMPのミトコンドリア輸送を担うものとして、酵母ThPPキャリアー(Tpc1p)、ヒトTpc、ショウジョウバエが同定されている。ThPPは、食事療法におけるチアミンの欠乏に起因する末梢神経系病気脚気との関連性から、ヒトの必須栄養素ビタミン)として初めて発見された。

TPPは多くの酵素反応において補酵素として働く:

化学

TPPの「イリド型」

化学的には、TPPはピリミジン環から成り、その環はチアゾール環に接続され、さらにその環はピロリン酸(第二リン酸)官能基に接続されている。

TPP分子で最もよく反応に関与する部分は、窒素硫黄を含むチアゾール環である。したがって、チアゾール環は分子の「試薬部分」である。この環のC2は、そのプロトンを供与してカルバニオンを形成することで、として作用することができる。通常、カルバニオンを形成する反応は非常に不利であるが、カルバニオンのすぐ隣の4価の窒素上の正電荷が負電荷を安定化させ、反応をより有利にする。隣接する原子に正と負の電荷を持つ化合物はイリドと呼ばれるので、TPPのカルバニオン型を「イリド型」と呼ぶこともある。

Reaction mechanisms

In several reactions, including that of pyruvate dehydrogenase, alpha-ketoglutarate dehydrogenase, and transketolase, TPP catalyses the reversible decarboxylation reaction (aka cleavage of a substrate compound at a carbon-carbon bond connecting a carbonyl group to an adjacent reactive group—usually a carboxylic acid or an alcohol). It achieves this in four basic steps:

  1. The carbanion of the TPP ylid nucleophilically attacks the carbonyl group on the substrate. (This forms a single bond between the TPP and the substrate.)
  2. The target bond on the substrate is broken, and its electrons are pushed towards the TPP. This creates a double bond between the substrate carbon and the TPP carbon and pushes the electrons in the N-C double bond in TPP entirely onto the nitrogen atom, reducing it from a positive to neutral form.
  3. In what is essentially the reverse of step two, the electrons push back in the opposite direction forming a new bond between the substrate carbon and another atom. (In the case of the decarboxylases, this creates a new carbon-hydrogen bond. In the case of transketolase, this attacks a new substrate molecule to form a new carbon-carbon bond.)
  4. In what is essentially the reverse of step one, the TPP-substrate bond is broken, reforming the TPP ylid and the substrate carbonyl.

TPP Mechanism

こちらも参照

外部リンク