Thiamine pyrophosphate/ja: Difference between revisions
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化学的には、TPPは[[pyrimidine/ja|ピリミジン]]環から成り、その環は[[thiazole/ja|チアゾール]]環に接続され、さらにその環は[[pyrophosphate/ja|ピロリン酸]](第二リン酸)[[functional group/ja|官能基]]に接続されている。 | 化学的には、TPPは[[pyrimidine/ja|ピリミジン]]環から成り、その環は[[thiazole/ja|チアゾール]]環に接続され、さらにその環は[[pyrophosphate/ja|ピロリン酸]](第二リン酸)[[functional group/ja|官能基]]に接続されている。 | ||
TPP分子で最もよく反応に関与する部分は、[[nitrogen/ja|窒素]]と[[sulfur/ja|硫黄]]を含むチアゾール環である。したがって、チアゾール環は分子の「試薬部分」である。この環のC2は、その[[proton/ja|プロトン]]を供与して[[carbanion/ja|カルバニオン]]を形成することで、[[acid/ja|酸]]として作用することができる。通常、カルバニオンを形成する反応は非常に不利であるが、カルバニオンのすぐ隣の4価の窒素上の正電荷が負電荷を安定化させ、反応をより有利にする。隣接する原子に正と負の電荷を持つ化合物は[[ylide/ja|イリド]]と呼ばれるので、TPPのカルバニオン型を「イリド型」と呼ぶこともある。 | |||
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Revision as of 15:04, 10 April 2024
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Names | |
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IUPAC name
2-[3-[(4-amino-2-methylpyrimidin-5-yl)methyl]-4-methyl-1,3-thiazol-3-ium-5-yl]ethyl phosphono hydrogen phosphate
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Other names
Thiamine diphosphate
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Identifiers | |
3D model (JSmol)
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ChEBI | |
ChemSpider | |
KEGG | |
MeSH | Thiamine+pyrophosphate |
PubChem CID
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UNII | |
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Properties | |
C12H19N4O7P2S+ | |
Molar mass | 425.314382 g/mol |
チアミンピロリン酸(TPPまたはThPP)、またはチアミン二リン酸(ThDP)、またはコカルボキシラーゼは、酵素によって生成されるチアミン(ビタミンB1)の誘導体である。[チアミンジホスホキナーゼ]]によって生成される。チアミン・ピロリン酸は補因子であり、すべての生体系に存在し、いくつかの生化学反応を触媒する。
チアミンピロリン酸は細胞質で合成され、細胞質ではトランスケトラーゼの活性に、ミトコンドリアではピルビン酸、オキソグルタル酸、分岐鎖ケト酸デヒドロゲナーゼの活性に必要である。現在までに、ThPPとThMPのミトコンドリア輸送を担うものとして、酵母ThPPキャリアー(Tpc1p)、ヒトTpc、ショウジョウバエが同定されている。ThPPは、食事療法におけるチアミンの欠乏に起因する末梢神経系の病気脚気との関連性から、ヒトの必須栄養素(ビタミン)として初めて発見された。
TPPは多くの酵素反応において補酵素として働く:
- ピルビン酸デヒドロゲナーゼ複合体
- エタノール発酵におけるピルビン酸脱炭酸酵素
- α-ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼ複合体
- 分岐鎖アミノ酸デヒドロゲナーゼ複合体
- 2-ヒドロキシフィタノイル-CoAリアーゼ
- トランスケトラーゼ
化学

化学的には、TPPはピリミジン環から成り、その環はチアゾール環に接続され、さらにその環はピロリン酸(第二リン酸)官能基に接続されている。
TPP分子で最もよく反応に関与する部分は、窒素と硫黄を含むチアゾール環である。したがって、チアゾール環は分子の「試薬部分」である。この環のC2は、そのプロトンを供与してカルバニオンを形成することで、酸として作用することができる。通常、カルバニオンを形成する反応は非常に不利であるが、カルバニオンのすぐ隣の4価の窒素上の正電荷が負電荷を安定化させ、反応をより有利にする。隣接する原子に正と負の電荷を持つ化合物はイリドと呼ばれるので、TPPのカルバニオン型を「イリド型」と呼ぶこともある。
Reaction mechanisms
In several reactions, including that of pyruvate dehydrogenase, alpha-ketoglutarate dehydrogenase, and transketolase, TPP catalyses the reversible decarboxylation reaction (aka cleavage of a substrate compound at a carbon-carbon bond connecting a carbonyl group to an adjacent reactive group—usually a carboxylic acid or an alcohol). It achieves this in four basic steps:
- The carbanion of the TPP ylid nucleophilically attacks the carbonyl group on the substrate. (This forms a single bond between the TPP and the substrate.)
- The target bond on the substrate is broken, and its electrons are pushed towards the TPP. This creates a double bond between the substrate carbon and the TPP carbon and pushes the electrons in the N-C double bond in TPP entirely onto the nitrogen atom, reducing it from a positive to neutral form.
- In what is essentially the reverse of step two, the electrons push back in the opposite direction forming a new bond between the substrate carbon and another atom. (In the case of the decarboxylases, this creates a new carbon-hydrogen bond. In the case of transketolase, this attacks a new substrate molecule to form a new carbon-carbon bond.)
- In what is essentially the reverse of step one, the TPP-substrate bond is broken, reforming the TPP ylid and the substrate carbonyl.
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The TPP thiazolium ring can be deprotonated at C2 to become an ylid.
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A full view of TPP. The arrow indicates the acidic proton.