Pyridoxal phosphate/ja: Difference between revisions

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''大腸菌''において、pdxB（エリスロン酸4リン酸脱水素酵素をコードする）の欠失によって引き起こされる補助栄養を抑制することができる「セレンディピタス経路」が過剰発現ライブラリーから発見された。セレンディピタス経路は非常に非効率的であったが、様々な酵素の[[enzyme promiscuity/ja|プロミスキューティ活性]]のおかげで可能であった。この経路は3-ホスホヒドロキシピルビン酸（セリン生合成の''serA''コード酵素の産物）から始まり、エリスロネート-4-リン酸を必要としなかった。3PHPは脱リン酸化され、その結果、不安定な中間体が生じ、この中間体は自発的に脱炭酸し（それゆえ、セリン生合成経路にはリン酸が存在する）、グリカルデヒドになる。グリカルデヒドはグリシンと縮合し、リン酸化された生成物は4-ホスホヒドロキシスレオニン（4PHT）であり、4-PHTデヒドロゲナーゼ（''pdxA''）の正規の基質である。

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====DXP非依存的生合成====

=~~===DXP-independent biosynthesis~~====

DXP非依存的なPLP生合成経路は、2つのサブユニットからなる酵素、PLP-シンターゼによって触媒されるステップからなる。PdxSはリブロース5-リン酸、グリセルアルデヒド-3-リン酸、[[ammonia/ja|アンモニア]]の縮合を触媒し、この後者の分子は[[glutamine/ja|グルタミン]]からアンモニアの生成を触媒するPdxTによって生成される。PdxSは(β/α)8バレル（TIMバレルとも呼ばれる）で、12量体を形成している。

~~The DXP-independent PLP~~-~~biosynthetic route consists of a step catalyzed by PLP~~-~~synthase, an enzyme composed of two subunits. PdxS catalyzes the condensation of ribulose 5-phosphate, glyceraldehyde~~-3-~~phosphate, and~~ [[ammonia]]~~, this latter molecules is produced by PdxT which catalyzes the production of ammonia from~~ [[glutamine]]~~. PdxS is a~~ (β/α)~~8 barrel (also known as a TIM-barrel) that forms a dodecamer.~~

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 ''大腸菌''において、pdxB（エリスロン酸4リン酸脱水素酵素をコードする）の欠失によって引き起こされる補助栄養を抑制することができる「セレンディピタス経路」が過剰発現ライブラリーから発見された。セレンディピタス経路は非常に非効率的であったが、様々な酵素の[[enzyme promiscuity/ja|プロミスキューティ活性]]のおかげで可能であった。この経路は3-ホスホヒドロキシピルビン酸（セリン生合成の''serA''コード酵素の産物）から始まり、エリスロネート-4-リン酸を必要としなかった。3PHPは脱リン酸化され、その結果、不安定な中間体が生じ、この中間体は自発的に脱炭酸し（それゆえ、セリン生合成経路にはリン酸が存在する）、グリカルデヒドになる。グリカルデヒドはグリシンと縮合し、リン酸化された生成物は4-ホスホヒドロキシスレオニン（4PHT）であり、4-PHTデヒドロゲナーゼ（''pdxA''）の正規の基質である。
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+====DXP非依存的生合成====
-====DXP-independent biosynthesis====
+DXP非依存的なPLP生合成経路は、2つのサブユニットからなる酵素、PLP-シンターゼによって触媒されるステップからなる。PdxSはリブロース5-リン酸、グリセルアルデヒド-3-リン酸、[[ammonia/ja|アンモニア]]の縮合を触媒し、この後者の分子は[[glutamine/ja|グルタミン]]からアンモニアの生成を触媒するPdxTによって生成される。PdxSは(β/α)8バレル（TIMバレルとも呼ばれる）で、12量体を形成している。
-The DXP-independent PLP-biosynthetic route consists of a step catalyzed by PLP-synthase, an enzyme composed of two subunits. PdxS catalyzes the condensation of ribulose 5-phosphate, glyceraldehyde-3-phosphate, and [[ammonia]], this latter molecules is produced by PdxT which catalyzes the production of ammonia from [[glutamine]]. PdxS is a (β/α)8 barrel (also known as a TIM-barrel) that forms a dodecamer.
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