Adipose tissue/ja: Difference between revisions

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脂肪組織は複雑な性質を持っており、褐変を制御する分子が増え続けているため、この分野の研究を向上させるために[[bioinformatics/ja|バイオインフォマティクス]]ツールを使用する大きな可能性が存在する。ベージュ脂肪は肥満や糖尿病の治療標的として急速に人気を集めているため、WATの褐変研究はこれらの技術の進歩から大きな恩恵を受けている。

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[[DNA microarray/ja|DNAマイクロアレイ]]は、様々な遺伝子の発現レベルを同時に定量化するために使用されるバイオインフォマティクスツールであり、脂肪組織の研究に広く使用されている。そのような研究のひとつに、マイクロアレイ解析とIngenuity IPAソフトウェアを併用し、マウスを28℃と6℃の温度に暴露したときのWATとBATの遺伝子発現の変化を調べたものがある。その後、最も有意に発現が増加した遺伝子と減少した遺伝子が同定され、発現経路の解析に用いられた。その結果、寒冷曝露後にWATで発現が上昇する経路の多くは、BATでも発現が高いことが判明した。例えば、[[oxidative phosphorylation/ja|酸化的リン酸化]]、[[fatty acid metabolism/ja|脂肪酸代謝]]、ピルビン酸代謝などである。このことは、脂肪細胞の一部が6 °Cでベージュ色の表現型に切り替わったことを示唆している。Mössenböckらはまた、マイクロアレイ解析を用いて、[[insulin/ja|インスリン]]欠乏はベージュ脂肪細胞の分化を阻害するが、褐変能力は妨げないことを示した。これら2つの研究は、WATの褐変研究にマイクロアレイを用いる可能性を示している。

[[DNA microarray]] is a bioinformatics tool used to quantify expression levels of various genes simultaneously, and has been used extensively in the study of adipose tissue. One such study used microarray analysis in conjunction with Ingenuity IPA software to look at changes in WAT and BAT gene expression when mice were exposed to temperatures of 28 and 6 °C. The most significantly up- and downregulated genes were then identified and used for analysis of differentially expressed pathways. It was discovered that many of the pathways upregulated in WAT after cold exposure are also highly expressed in BAT, such as [[oxidative phosphorylation]], [[fatty acid metabolism]]~~, and pyruvate metabolism. This suggests that some of the adipocytes switched to a beige phenotype at 6~~ ~~°C. Mössenböck et al. also used microarray analysis to demonstrate that~~ [[insulin]] deficiency inhibits the differentiation of beige adipocytes but does not disturb their capacity for browning. These two studies demonstrate the potential for the use of microarray in the study of WAT browning.

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 脂肪組織は複雑な性質を持っており、褐変を制御する分子が増え続けているため、この分野の研究を向上させるために[[bioinformatics/ja|バイオインフォマティクス]]ツールを使用する大きな可能性が存在する。ベージュ脂肪は肥満や糖尿病の治療標的として急速に人気を集めているため、WATの褐変研究はこれらの技術の進歩から大きな恩恵を受けている。
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+[[DNA microarray/ja|DNAマイクロアレイ]]は、様々な遺伝子の発現レベルを同時に定量化するために使用されるバイオインフォマティクスツールであり、脂肪組織の研究に広く使用されている。そのような研究のひとつに、マイクロアレイ解析とIngenuity IPAソフトウェアを併用し、マウスを28℃と6℃の温度に暴露したときのWATとBATの遺伝子発現の変化を調べたものがある。その後、最も有意に発現が増加した遺伝子と減少した遺伝子が同定され、発現経路の解析に用いられた。その結果、寒冷曝露後にWATで発現が上昇する経路の多くは、BATでも発現が高いことが判明した。例えば、[[oxidative phosphorylation/ja|酸化的リン酸化]]、[[fatty acid metabolism/ja|脂肪酸代謝]]、ピルビン酸代謝などである。このことは、脂肪細胞の一部が6&nbsp;°Cでベージュ色の表現型に切り替わったことを示唆している。Mössenböckらはまた、マイクロアレイ解析を用いて、[[insulin/ja|インスリン]]欠乏はベージュ脂肪細胞の分化を阻害するが、褐変能力は妨げないことを示した。これら2つの研究は、WATの褐変研究にマイクロアレイを用いる可能性を示している。
-[[DNA microarray]] is a bioinformatics tool used to quantify expression levels of various genes simultaneously, and has been used extensively in the study of adipose tissue. One such study used microarray analysis in conjunction with Ingenuity IPA software to look at changes in WAT and BAT gene expression when mice were exposed to temperatures of 28 and 6&nbsp;°C. The most significantly up- and downregulated genes were then identified and used for analysis of differentially expressed pathways. It was discovered that many of the pathways upregulated in WAT after cold exposure are also highly expressed in BAT, such as [[oxidative phosphorylation]], [[fatty acid metabolism]], and pyruvate metabolism. This suggests that some of the adipocytes switched to a beige phenotype at 6&nbsp;°C. Mössenböck et al. also used microarray analysis to demonstrate that [[insulin]] deficiency inhibits the differentiation of beige adipocytes but does not disturb their capacity for browning. These two studies demonstrate the potential for the use of microarray in the study of WAT browning.
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