Metabolism/ja: Difference between revisions

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酸化的リン酸化では、クエン酸サイクルのような領域で有機分子から取り除かれた電子が酸素に移動し、放出されたエネルギーを使ってATPが作られる。これは[[eukaryote/ja|真核生物]]では[[electron transport chain/ja|電子伝達鎖]]と呼ばれるミトコンドリアの膜にある一連のタンパク質によって行われる。[[prokaryote/ja|原核生物]]では、これらのタンパク質は細胞の[[bacterial cell structure/ja|内膜]]に存在する。これらのタンパク質は、NADHのような[[reducing agent/ja|被還元]]分子のエネルギーを使って、膜を横切って[[proton/ja|プロトン]]を送り出す。

~~In oxidative phosphorylation, the electrons removed from organic molecules in areas such as the citric acid cycle are transferred to oxygen and the energy released is used to make ATP. This is done in~~ [[eukaryote]]~~s by a series of proteins in the membranes of mitochondria called the~~ [[electron transport chain]]~~. In~~ [[prokaryote]]~~s, these proteins are found in the cell's~~ [[bacterial cell structure|~~inner membrane~~]]~~. These proteins use the energy from~~ [[reducing agent|~~reduced~~]] ~~molecules like NADH to pump~~ [[proton]]~~s across a membrane.~~

[[File:ATPsyn.gif|thumb|right|[[ATP synthase/ja|ATP合成酵素]]のメカニズム。ATPを赤、ADPとリン酸をピンク、回転する茎サブユニットを黒で示す。]]

[[File:ATPsyn.gif|thumb|right|~~Mechanism of~~ [[ATP synthase]]~~. ATP is shown in red, ADP and phosphate in pink and the rotating stalk subunit in black.~~]]

ミトコンドリアからプロトンを送り出すと、膜を横切ってプロトンの[[diffusion/ja|濃度差]]が生じ、[[electrochemical gradient/ja|電気化学的勾配]]が発生する。この力によって、プロトンは[[ATP synthase/ja|ATP合成酵素]]と呼ばれる酵素の基部を通ってミトコンドリア内に戻る。プロトンの流れは茎サブユニットを回転させ、合成酵素ドメインの[[active site/ja|活性部位]]の形状を変化させ、[[adenosine diphosphate/ja|アデノシン二リン酸]] をリン酸化させ、ATPに変える。

~~Pumping protons out of the mitochondria creates a proton~~ [[diffusion|~~concentration difference~~]] ~~across the membrane and generates an~~ [[electrochemical gradient]]~~. This force drives protons back into the mitochondrion through the base of an enzyme called~~ [[ATP synthase]]~~. The flow of protons makes the stalk subunit rotate, causing the~~ [[active site]] ~~of the synthase domain to change shape and phosphorylate~~ [[adenosine diphosphate]] ~~– turning it into ATP.~~

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===無機化合物からのエネルギー===

~~===Energy from inorganic compounds~~===

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+酸化的リン酸化では、クエン酸サイクルのような領域で有機分子から取り除かれた電子が酸素に移動し、放出されたエネルギーを使ってATPが作られる。これは[[eukaryote/ja|真核生物]]では[[electron transport chain/ja|電子伝達鎖]]と呼ばれるミトコンドリアの膜にある一連のタンパク質によって行われる。[[prokaryote/ja|原核生物]]では、これらのタンパク質は細胞の[[bacterial cell structure/ja|内膜]]に存在する。これらのタンパク質は、NADHのような[[reducing agent/ja|被還元]]分子のエネルギーを使って、膜を横切って[[proton/ja|プロトン]]を送り出す。
-In oxidative phosphorylation, the electrons removed from organic molecules in areas such as the citric acid cycle are transferred to oxygen and the energy released is used to make ATP. This is done in [[eukaryote]]s by a series of proteins in the membranes of mitochondria called the [[electron transport chain]]. In [[prokaryote]]s, these proteins are found in the cell's [[bacterial cell structure|inner membrane]]. These proteins use the energy from [[reducing agent|reduced]] molecules like NADH to pump [[proton]]s across a membrane.
+[[File:ATPsyn.gif|thumb|right|[[ATP synthase/ja|ATP合成酵素]]のメカニズム。ATPを赤、ADPとリン酸をピンク、回転する茎サブユニットを黒で示す。]]
-[[File:ATPsyn.gif|thumb|right|Mechanism of [[ATP synthase]]. ATP is shown in red, ADP and phosphate in pink and the rotating stalk subunit in black.]]
+ミトコンドリアからプロトンを送り出すと、膜を横切ってプロトンの[[diffusion/ja|濃度差]]が生じ、[[electrochemical gradient/ja|電気化学的勾配]]が発生する。この力によって、プロトンは[[ATP synthase/ja|ATP合成酵素]]と呼ばれる酵素の基部を通ってミトコンドリア内に戻る。プロトンの流れは茎サブユニットを回転させ、合成酵素ドメインの[[active site/ja|活性部位]]の形状を変化させ、[[adenosine diphosphate/ja|アデノシン二リン酸]]&nbsp;をリン酸化させ、ATPに変える。
-Pumping protons out of the mitochondria creates a proton [[diffusion|concentration difference]] across the membrane and generates an [[electrochemical gradient]]. This force drives protons back into the mitochondrion through the base of an enzyme called [[ATP synthase]]. The flow of protons makes the stalk subunit rotate, causing the [[active site]] of the synthase domain to change shape and phosphorylate [[adenosine diphosphate]]&nbsp;– turning it into ATP.
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+===無機化合物からのエネルギー===
-===Energy from inorganic compounds===
+{{further/ja|Microbial metabolism/ja|Nitrogen cycle/ja}}
-{{further|Microbial metabolism|Nitrogen cycle}}
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