Citric acid cycle/ja: Difference between revisions

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真核生物と原核生物の間にはいくつかの違いがある。D-''スレオ''-イソクエン酸から2-オキソグルタル酸への変換は、真核生物ではNAD<sup>+</sup>依存性[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.1.41 EC 1.1.1.41]によって触媒されるが、原核生物ではNADP<sup>+</sup>依存性[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.1.42 EC 1.1.1.42]が用いられる。同様に、(''S'')-リンゴ酸からオキサロ酢酸への変換は、真核生物ではNAD<sup>+</sup>依存性[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.1.37 EC 1.1.1.37]によって触媒されるが、ほとんどの原核生物はキノン依存性酵素[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.5.4 EC 1.1.5.4]を利用している。

~~<div lang="en" dir="ltr" class="mw~~-~~content-ltr">~~

大きく変動するステップは、コハク酸へのコハク酸-CoAの変換である。ほとんどの生物は、[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.5 EC 6.2.1.5]のコハク酸-CoAリガーゼ（ADP形成）を利用している（その名前にもかかわらず、この酵素はATP形成方向の経路で作用する）。哺乳類では、GTP形成酵素であるコハク酸-CoAリガーゼ（GDP形成）（[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 EC 6.2.1.4]）も働いている。各アイソフォームの利用度は組織に依存する。Acetobacter aceti''のようないくつかの酢酸産生菌では、全く別の酵素がこの変換を触媒する - [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.18 EC 2.8.3.18]、succinyl-CoA:acetate CoA-transferaseである。この特殊な酵素は、これらの生物においてTCAサイクルと酢酸代謝を結びつけている。ヘリコバクター・ピロリ（''Helicobacter pylori''）などの一部の細菌は、この変換にさらに別の酵素を用いる。

~~A step with significant variability is the conversion of succinyl-CoA to succinate. Most organisms utilize~~ [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.5 EC 6.2.1.5]~~, succinate–CoA ligase (ADP-forming) (despite its name, the enzyme operates in the pathway in the direction of ATP formation). In mammals a GTP~~-~~forming enzyme, succinate–CoA ligase (GDP~~-~~forming) (~~[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 EC 6.2.1.4]~~) also operates. The level of utilization of each isoform is tissue dependent. In some acetate-producing bacteria, such as ''Acetobacter~~ aceti''~~, an entirely different enzyme catalyzes this conversion~~ – [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.18 EC 2.8.3.18]~~, succinyl~~-CoA:acetate CoA-~~transferase. This specialized enzyme links the TCA cycle with acetate metabolism in these organisms. Some bacteria, such as~~ ''Helicobacter pylori''~~, employ yet another enzyme for this conversion – succinyl-CoA:acetoacetate CoA-transferase ([http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.5 EC 2.8.3.5]).~~

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 真核生物と原核生物の間にはいくつかの違いがある。D-''スレオ''-イソクエン酸から2-オキソグルタル酸への変換は、真核生物ではNAD<sup>+</sup>依存性[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.1.41 EC 1.1.1.41]によって触媒されるが、原核生物ではNADP<sup>+</sup>依存性[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.1.42 EC 1.1.1.42]が用いられる。同様に、(''S'')-リンゴ酸からオキサロ酢酸への変換は、真核生物ではNAD<sup>+</sup>依存性[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.1.37 EC 1.1.1.37]によって触媒されるが、ほとんどの原核生物はキノン依存性酵素[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=1.1.5.4 EC 1.1.5.4]を利用している。
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+大きく変動するステップは、コハク酸へのコハク酸-CoAの変換である。ほとんどの生物は、[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.5 EC 6.2.1.5]のコハク酸-CoAリガーゼ（ADP形成）を利用している（その名前にもかかわらず、この酵素はATP形成方向の経路で作用する）。哺乳類では、GTP形成酵素であるコハク酸-CoAリガーゼ（GDP形成）（[http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 EC 6.2.1.4]）も働いている。各アイソフォームの利用度は組織に依存する。Acetobacter aceti''のようないくつかの酢酸産生菌では、全く別の酵素がこの変換を触媒する&nbsp;- [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.18 EC 2.8.3.18]、succinyl-CoA:acetate CoA-transferaseである。この特殊な酵素は、これらの生物においてTCAサイクルと酢酸代謝を結びつけている。ヘリコバクター・ピロリ（''Helicobacter pylori''）などの一部の細菌は、この変換にさらに別の酵素を用いる。
-A step with significant variability is the conversion of succinyl-CoA to succinate. Most organisms utilize [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.5 EC 6.2.1.5], succinate–CoA ligase (ADP-forming) (despite its name, the enzyme operates in the pathway in the direction of ATP formation). In mammals a GTP-forming enzyme, succinate–CoA ligase (GDP-forming) ([http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 EC 6.2.1.4]) also operates. The level of utilization of each isoform is tissue dependent. In some acetate-producing bacteria, such as ''Acetobacter aceti'', an entirely different enzyme catalyzes this conversion&nbsp;– [http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.18 EC 2.8.3.18], succinyl-CoA:acetate CoA-transferase. This specialized enzyme links the TCA cycle with acetate metabolism in these organisms. Some bacteria, such as ''Helicobacter pylori'', employ yet another enzyme for this conversion&nbsp;– succinyl-CoA:acetoacetate CoA-transferase ([http://www.enzyme-database.org/query.php?ec=2.8.3.5 EC 2.8.3.5]).
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