Cytochrome P450/ja: Difference between revisions

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==命名法==

==Nomenclature==

[[Gene]]~~s encoding P450 enzymes, and the enzymes themselves, are designated with the~~ [[gene nomenclature#Symbol and name|~~root symbol~~]] '''CYP''' ~~for the [[protein superfamily|superfamily]], followed by a number indicating the~~ [[gene family]]~~, a capital letter indicating the subfamily, and another numeral for the individual gene. The convention is to~~ ''[[Italic type|~~italicise~~]]'' ~~the name when referring to the gene. For example,~~ ''CYP2E1'' ~~is the gene that encodes the enzyme~~ [[~~CYP2E1~~]]~~—one of the enzymes involved in~~ [[~~paracetamol~~]] ~~(acetaminophen) metabolism. The '~~''CYP''~~' nomenclature is the official naming convention, although occasionally~~ '''CYP450''' or '''CYP450''' is used synonymously. These names should never be used as according to the nomenclature convention (as they denote a P450 in family number 450). However, some gene or enzyme names for P450s are also referred to by historical names (e.g. P450BM3 ~~for CYP102A1) or functional names, denoting the catalytic activity and the name of the compound used as substrate. Examples include~~ [[CYP5A1]], [[thromboxane]] A2 ~~synthase~~, ~~abbreviated to~~ [[Thromboxane-A synthase|TBXAS1]] ('''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''2 '''S'''ynthase '''1'''~~), and~~ [[CYP51A1]], ~~lanosterol 14~~-α-~~demethylase, sometimes unofficially abbreviated to LDM according to its substrate (~~'''L'''~~anosterol) and activity (~~'''D'''e'''M'''~~ethylation).~~

P450酵素をコードする[[Gene/ja|遺伝子]]および酵素自体は、[[protein superfamily/ja|スーパーファミリー]]を表す[[gene nomenclature/ja#Symbol and name|ルート記号]]'''CYP'''の後に、[[gene family/ja|遺伝子ファミリー]]を表す数字、サブファミリーを表す大文字、個々の遺伝子を表す別の数字が続く。遺伝子に言及する際には''[[:en:Italic type|イタリック体]]''で表記するのが慣例である。例えば、''CYP2E1'' は[[paracetamol/ja|パラセタモール]]（アセトアミノフェン）の代謝に関与する酵素の一つである[[CYP2E1/ja|CYP2E1]]をコードする遺伝子である。''CYP''命名法は公式の命名規則であるが、'''CYP450'''または'''CYP450'''が同義語として用いられることもある。これらの名称は、命名規則に従って（ファミリー番号450のP450を示すため）決して使用すべきではない。しかし、P450の遺伝子名や酵素名の中には、歴史的な名称（例えば、CYP102A1のP450BM3）や、触媒活性や基質として使用される化合物の名称を示す機能名で呼ばれるものもある。例えば、[[CYP5A1/ja|CYP5A1]]、[[thromboxane/ja|トロンボキサン]]A2合成, [[Thromboxane-A synthase/ja|TBXAS1]]（'''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''2 '''S'''ynthase '''1'''）、[[CYP51A1/ja|CYP51A1]], ラノステロール14-α-デメチラーゼ、基質（'''L'''anosterol）と活性（'''D'''e'''M'''ethylation）により、非公式にLDMと略されることもある。

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 P450は一般に[[electron transfer/ja|電子伝達]]鎖の末端酸化酵素であり、大別すると[[P450-containing systems/ja|P450含有系]]となる。"P450"という用語は、酵素が[[redox/ja|酸化還元]]状態で[[carbon monoxide/ja|一酸化炭素]]と複合体化したときの[[absorption spectroscopy/ja|吸収極大]]の[[spectrophotometry/ja|分光光度]][[:en:wavelength|波長]]（450&nbsp;[[:en:nanometre|nm]]）にあるピークに由来する。ほとんどのP450は、[[iron/ja|鉄]]（そして最終的には分子状の[[oxygen/ja|酸素]]）を還元するために1つ以上の[[electron/ja|電子]]を供給するタンパク質パートナーを必要とする。
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+==命名法==
-==Nomenclature==
+{{Anchor|Nomenclature}}
-[[Gene]]s encoding P450 enzymes, and the enzymes themselves, are designated with the [[gene nomenclature#Symbol and name|root symbol]] '''CYP''' for the [[protein superfamily|superfamily]], followed by a number indicating the [[gene family]], a capital letter indicating the subfamily, and another numeral for the individual gene. The convention is to ''[[Italic type|italicise]]'' the name when referring to the gene. For example, ''CYP2E1'' is the gene that encodes the enzyme [[CYP2E1]]—one of the enzymes involved in [[paracetamol]] (acetaminophen) metabolism. The '''CYP''' nomenclature is the official naming convention, although occasionally '''CYP450''' or '''CYP<sub>450</sub>''' is used synonymously. These names should never be used as according to the nomenclature convention (as they denote a P450 in family number 450). However, some gene or enzyme names for P450s are also referred to by historical names (e.g. P450<sub>BM3</sub> for CYP102A1) or functional names, denoting the catalytic activity and the name of the compound used as substrate. Examples include [[CYP5A1]], [[thromboxane]] A<sub>2</sub> synthase, abbreviated to [[Thromboxane-A synthase|TBXAS1]] ('''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''<sub>2</sub> '''S'''ynthase '''1'''), and [[CYP51A1]], lanosterol 14-α-demethylase, sometimes unofficially abbreviated to LDM according to its substrate ('''L'''anosterol) and activity ('''D'''e'''M'''ethylation).
+P450酵素をコードする[[Gene/ja|遺伝子]]および酵素自体は、[[protein superfamily/ja|スーパーファミリー]]を表す[[gene nomenclature/ja#Symbol and name|ルート記号]]'''CYP'''の後に、[[gene family/ja|遺伝子ファミリー]]を表す数字、サブファミリーを表す大文字、個々の遺伝子を表す別の数字が続く。遺伝子に言及する際には''[[:en:Italic type|イタリック体]]''で表記するのが慣例である。例えば、''CYP2E1'' は[[paracetamol/ja|パラセタモール]]（アセトアミノフェン）の代謝に関与する酵素の一つである[[CYP2E1/ja|CYP2E1]]をコードする遺伝子である。''CYP''命名法は公式の命名規則であるが、'''CYP450'''または'''CYP<sub>450</sub>'''が同義語として用いられることもある。これらの名称は、命名規則に従って（ファミリー番号450のP450を示すため）決して使用すべきではない。しかし、P450の遺伝子名や酵素名の中には、歴史的な名称（例えば、CYP102A1のP450<sub>BM3</sub>）や、触媒活性や基質として使用される化合物の名称を示す機能名で呼ばれるものもある。例えば、[[CYP5A1/ja|CYP5A1]]、[[thromboxane/ja|トロンボキサン]]A<sub>2</sub>合成, [[Thromboxane-A synthase/ja|TBXAS1]]（'''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''<sub>2</sub> '''S'''ynthase '''1'''）、[[CYP51A1/ja|CYP51A1]], ラノステロール14-α-デメチラーゼ、基質（'''L'''anosterol）と活性（'''D'''e'''M'''ethylation）により、非公式にLDMと略されることもある。
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