Adipose tissue/ja: Difference between revisions

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RNAシーケンス（[[RNA-Seq/ja|RNA-Seq]]）は、サンプル内の全遺伝子のRNA発現を定量化できる強力な計算ツールである。RNA-Seqを褐変研究に取り入れることは、他の方法よりも特異性、感度、遺伝子発現の包括的な概観が得られるため、大きな価値がある。RNA-Seqはヒトとマウスの両方の研究で使用されており、遺伝子発現プロファイルに従って褐色脂肪細胞の特徴を明らかにし、褐色表現型を誘導する可能性のある治療分子を同定することを試みている。そのような研究の1つでは、野生型[[wild type/ja|(WT)]]マウスとEarly B-Cell Factor-2（EBF2）を過剰発現させたマウスのWATの遺伝子発現プロファイルを比較するためにRNA-Seqを用いた。トランスジェニック動物のWATは褐色脂肪遺伝子プログラムを示し、WTマウスと比較してWAT特異的遺伝子発現が低下していた。したがって、EBF2は褐色化を誘導する治療分子として同定された。

~~Chromatin immunoprecipitation with sequencing~~ [[ChIP-sequencing|(ChIP-seq)]~~] is a method used to identify protein binding sites on DNA and assess~~ [[histone]] ~~modifications. This tool has enabled examination of~~ [[epigenetics|~~epigenetic~~]] ~~regulation of browning and helps elucidate the mechanisms by which protein~~-DNA interactions stimulate the differentiation of beige adipocytes. Studies observing the chromatin landscapes of beige adipocytes have found that adipogenesis of these cells results from the formation of cell specific chromatin landscapes, which regulate the transcriptional program and, ultimately, control differentiation. Using ChIP-~~seq in conjunction with other tools, recent studies have identified over 30 transcriptional and epigenetic factors that influence beige adipocyte development.~~

[[ChIP-sequencing/ja|(ChIP-seq)]は、DNA上のタンパク質結合部位を同定し、[[histone/ja|ヒストン]]修飾を評価するために用いられる手法である。このツールにより、褐変の[[epigenetics/ja|エピジェネティック]]制御の研究が可能になり、タンパク質-DNA相互作用がベージュ脂肪細胞の分化を刺激するメカニズムの解明に役立っている。ベージュ脂肪細胞のクロマチンランドスケープを観察する研究から、これらの細胞の脂肪形成は、細胞特異的なクロマチンランドスケープの形成に起因し、それが転写プログラムを制御し、最終的には分化を制御することがわかった。ChIP-seqと他のツールを併用した最近の研究では、ベージュ脂肪細胞の発生に影響を与える30以上の転写因子とエピジェネティック因子が同定された。

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 RNAシーケンス（[[RNA-Seq/ja|RNA-Seq]]）は、サンプル内の全遺伝子のRNA発現を定量化できる強力な計算ツールである。RNA-Seqを褐変研究に取り入れることは、他の方法よりも特異性、感度、遺伝子発現の包括的な概観が得られるため、大きな価値がある。RNA-Seqはヒトとマウスの両方の研究で使用されており、遺伝子発現プロファイルに従って褐色脂肪細胞の特徴を明らかにし、褐色表現型を誘導する可能性のある治療分子を同定することを試みている。そのような研究の1つでは、野生型[[wild type/ja|(WT)]]マウスとEarly B-Cell Factor-2（EBF2）を過剰発現させたマウスのWATの遺伝子発現プロファイルを比較するためにRNA-Seqを用いた。トランスジェニック動物のWATは褐色脂肪遺伝子プログラムを示し、WTマウスと比較してWAT特異的遺伝子発現が低下していた。したがって、EBF2は褐色化を誘導する治療分子として同定された。
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-Chromatin immunoprecipitation with sequencing [[ChIP-sequencing|(ChIP-seq)]] is a method used to identify protein binding sites on DNA and assess [[histone]] modifications. This tool has enabled examination of [[epigenetics|epigenetic]] regulation of browning and helps elucidate the mechanisms by which protein-DNA interactions stimulate the differentiation of beige adipocytes. Studies observing the chromatin landscapes of beige adipocytes have found that adipogenesis of these cells results from the formation of cell specific chromatin landscapes, which regulate the transcriptional program and, ultimately, control differentiation. Using ChIP-seq in conjunction with other tools, recent studies have identified over 30 transcriptional and epigenetic factors that influence beige adipocyte development.
+[[ChIP-sequencing/ja|(ChIP-seq)]は、DNA上のタンパク質結合部位を同定し、[[histone/ja|ヒストン]]修飾を評価するために用いられる手法である。このツールにより、褐変の[[epigenetics/ja|エピジェネティック]]制御の研究が可能になり、タンパク質-DNA相互作用がベージュ脂肪細胞の分化を刺激するメカニズムの解明に役立っている。ベージュ脂肪細胞のクロマチンランドスケープを観察する研究から、これらの細胞の脂肪形成は、細胞特異的なクロマチンランドスケープの形成に起因し、それが転写プログラムを制御し、最終的には分化を制御することがわかった。ChIP-seqと他のツールを併用した最近の研究では、ベージュ脂肪細胞の発生に影響を与える30以上の転写因子とエピジェネティック因子が同定された。
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