Metabolism/ja: Difference between revisions

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古典的には、代謝は単一の代謝経路に焦点を当てた[[reductionism/ja|還元]]アプローチによって研究される。

~~Classically, metabolism is studied by a~~ [[reductionism|~~reductionist~~]] ~~approach that focuses on a single metabolic pathway. Particularly valuable is the use of~~ [[radioactive tracer]]s at the whole-organism, tissue and cellular levels, which define the paths from precursors to final products by identifying radioactively labelled intermediates and products. The enzymes that catalyze these chemical reactions can then be [[protein purification|~~purified~~]] ~~and their~~ [[enzyme kinetics|~~kinetics~~]] ~~and responses to~~ [[enzyme inhibitor|~~inhibitors~~]] investigated. A parallel approach is to identify the small molecules in a cell or tissue; the complete set of these molecules is called the [[metabolome]]. Overall, these studies give a good view of the structure and function of simple metabolic pathways, but are inadequate when applied to more complex systems such as the metabolism of a complete cell.

特に有用なのは、[[radioactive tracer/ja|放射性トレーサー]]を全組織、組織、細胞レベルで用いることである。このトレーサーは、放射性標識された中間体や生成物を同定することによって、前駆体から最終生成物までの経路を定義する。

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そして、これらの化学反応を触媒する酵素を[[protein purification/ja|精製]]し、その[[enzyme kinetics/ja|動力学]]や[[enzyme inhibitor/ja|阻害剤]]に対する反応を調べることができる。

これと並行して、細胞や組織内の低分子を同定するアプローチもある。

全体として、これらの研究は単純な代謝経路の構造と機能をよく知ることができるが、完全な細胞の代謝のような複雑な系に適用するには不十分である。

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 [[File:A thaliana metabolic network.png|thumb|upright=1.35|right|''[[Arabidopsis thaliana/ja|シロイヌナズナ]]''[[citric acid cycle/ja|クエン酸サイクル]]の[[Metabolic network/ja|代謝ネットワーク]]。[[enzyme/ja|酵素]]と[[metabolite/ja|代謝物]]を赤い四角で示し、それらの間の相互作用を黒い線で示した。]]
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+古典的には、代謝は単一の代謝経路に焦点を当てた[[reductionism/ja|還元]]アプローチによって研究される。
-Classically, metabolism is studied by a [[reductionism|reductionist]] approach that focuses on a single metabolic pathway. Particularly valuable is the use of [[radioactive tracer]]s at the whole-organism, tissue and cellular levels, which define the paths from precursors to final products by identifying radioactively labelled intermediates and products. The enzymes that catalyze these chemical reactions can then be [[protein purification|purified]] and their [[enzyme kinetics|kinetics]] and responses to [[enzyme inhibitor|inhibitors]] investigated. A parallel approach is to identify the small molecules in a cell or tissue; the complete set of these molecules is called the [[metabolome]]. Overall, these studies give a good view of the structure and function of simple metabolic pathways, but are inadequate when applied to more complex systems such as the metabolism of a complete cell.
+特に有用なのは、[[radioactive tracer/ja|放射性トレーサー]]を全組織、組織、細胞レベルで用いることである。このトレーサーは、放射性標識された中間体や生成物を同定することによって、前駆体から最終生成物までの経路を定義する。
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+そして、これらの化学反応を触媒する酵素を[[protein purification/ja|精製]]し、その[[enzyme kinetics/ja|動力学]]や[[enzyme inhibitor/ja|阻害剤]]に対する反応を調べることができる。
+これと並行して、細胞や組織内の低分子を同定するアプローチもある。
+全体として、これらの研究は単純な代謝経路の構造と機能をよく知ることができるが、完全な細胞の代謝のような複雑な系に適用するには不十分である。
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