Thiamine pyrophosphate/ja: Difference between revisions
Thiamine pyrophosphate/ja
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'''チアミンピロリン酸'''('''TPP'''または'''ThPP''')、または'''チアミン二リン酸'''('''ThDP''')、または'''コカルボキシラーゼ'''は、[[enzyme/ja|酵素]]によって生成される[[thiamin/ja|チアミン]](ビタミンB<sub>1</sub>)の[[derivative (chemistry)/ja|誘導体]] | '''チアミンピロリン酸'''('''TPP'''または'''ThPP''')、または'''チアミン二リン酸'''('''ThDP''')、または'''コカルボキシラーゼ'''は、[[enzyme/ja|酵素]][[thiamine diphosphokinase/ja|チアミンジホスホキナーゼ]]によって生成される[[thiamin/ja|チアミン]](ビタミンB<sub>1</sub>)の[[derivative (chemistry)/ja|誘導体]]である。チアミン・ピロリン酸は[[cofactor (biochemistry)/ja|補因子]]であり、すべての生体系に存在し、いくつかの[[Biochemistry/ja|生化学]]反応を触媒する。 | ||
チアミンピロリン酸は[[cytosol/ja|細胞質]]で合成され、細胞質ではトランスケトラーゼの活性に、ミトコンドリアではピルビン酸、オキソグルタル酸、分岐鎖ケト酸デヒドロゲナーゼの活性に必要である。現在までに、ThPPとThMPのミトコンドリア輸送を担うものとして、酵母ThPPキャリアー(Tpc1p)、ヒトTpc、''[[Drosophila melanogaster/ja|ショウジョウバエ]]''が同定されている。ThPPは、[[diet (nutrition)/ja|食事療法]]におけるチアミンの欠乏に起因する[[peripheral nervous system/ja|末梢神経系]]の[[disease/ja|病気]][[beriberi/ja|脚気]]との関連性から、ヒトの[[essential nutrient/ja|必須栄養素]]([[vitamin/ja|ビタミン]])として初めて発見された。 | チアミンピロリン酸は[[cytosol/ja|細胞質]]で合成され、細胞質ではトランスケトラーゼの活性に、ミトコンドリアではピルビン酸、オキソグルタル酸、分岐鎖ケト酸デヒドロゲナーゼの活性に必要である。現在までに、ThPPとThMPのミトコンドリア輸送を担うものとして、酵母ThPPキャリアー(Tpc1p)、ヒトTpc、''[[Drosophila melanogaster/ja|ショウジョウバエ]]''が同定されている。ThPPは、[[diet (nutrition)/ja|食事療法]]におけるチアミンの欠乏に起因する[[peripheral nervous system/ja|末梢神経系]]の[[disease/ja|病気]][[beriberi/ja|脚気]]との関連性から、ヒトの[[essential nutrient/ja|必須栄養素]]([[vitamin/ja|ビタミン]])として初めて発見された。 | ||
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[[Image:TPP-ylide.svg|thumb|right|TPPの「イリド型」]] | [[Image:TPP-ylide.svg|thumb|right|TPPの「イリド型」]] | ||
化学的には、TPPは[[pyrimidine/ja|ピリミジン]]環から成り、その環は[[thiazole/ja|チアゾール]]環に接続され、さらにその環は[[pyrophosphate/ja|ピロリン酸]](第二リン酸)[[functional group/ja|官能基]]に接続されている。 | |||
TPP分子で最もよく反応に関与する部分は、[[nitrogen/ja|窒素]]と[[sulfur/ja|硫黄]]を含むチアゾール環である。したがって、チアゾール環は分子の「試薬部分」である。この環のC2は、その[[proton/ja|プロトン]]を供与して[[carbanion/ja|カルバニオン]]を形成することで、[[acid/ja|酸]]として作用することができる。通常、カルバニオンを形成する反応は非常に不利であるが、カルバニオンのすぐ隣の4価の窒素上の正電荷が負電荷を安定化させ、反応をより有利にする。隣接する原子に正と負の電荷を持つ化合物は[[ylide/ja|イリド]]と呼ばれるので、TPPのカルバニオン型を「イリド型」と呼ぶこともある。 | |||
==反応のメカニズム{{Anchor|Reaction mechanisms}}== | |||
==Reaction mechanisms== | ピルビン酸デヒドロゲナーゼ、α-ケトグルタル酸デヒドロゲナーゼ、トランスケトラーゼなどのいくつかの反応において、TPPは可逆的な脱炭酸反応(基質化合物の、[[carbonyl group/ja|カルボニル基]]と隣接する反応性基-通常は[[carboxylic acid/ja|カルボン酸]]または[[Alcohol (chemistry)/ja|アルコール]]-をつなぐ炭素-炭素結合の開裂)を触媒する。これは4つの基本的なステップで達成される: | ||
#TPPイリドのカルバニオンは[[nucleophilic attack/ja|求核攻撃]]基質のカルボニル基を攻撃する。 (これはTPPと基質の間に単結合を形成する)。 | |||
# | #基質上の標的結合は切断され、その電子はTPPに向かって押し出される。 これは基質の炭素とTPPの炭素の間に二重結合を作り、TPPのN-C二重結合の電子を完全に窒素原子に押しつけ、窒素原子をプラスから中性に還元する。 | ||
# | #ステップ2の逆で、電子は反対方向に押し戻され、基質炭素と別の原子の間に新たな結合を形成する。(脱炭酸酵素の場合、これは新しい炭素-水素結合を形成する。 トランスケトラーゼの場合、これは新しい基質分子を攻撃し、新しい炭素-炭素結合を形成する)。 | ||
# | #ステップ1とは本質的に逆で、TPP-基質結合が切断され、TPPイリドと基質カルボニルが再構成される。 | ||
# | |||
[[File:TPP Mechanism.svg| | [[File:TPP Mechanism.svg|TPPメカニズム]] | ||
<gallery mode=packed style="text-align:left"> | <gallery mode=packed style="text-align:left"> | ||
Image:TPP_thiazolium.svg| | Image:TPP_thiazolium.svg|TPPチアゾリウム環はC2で脱プロトン化され、イリドになることができる。 | ||
Image:Thiamine pyrophosphate ng.png| | Image:Thiamine pyrophosphate ng.png|TPPの全容。 矢印は酸性プロトンを示す。 | ||
</gallery> | </gallery> | ||
==こちらも参照== | |||
* [[TPP riboswitch/ja]] | |||
* [[TPP riboswitch]] | |||
==外部リンク== | |||
*[http://www.uic.edu/classes/phar/phar332/Clinical_Cases/vitamin%20cases/thiamin/thiamin_pyrophosphate.htm UIC.edu] | *[http://www.uic.edu/classes/phar/phar332/Clinical_Cases/vitamin%20cases/thiamin/thiamin_pyrophosphate.htm UIC.edu] | ||
{{Enzyme cofactors/ja}} | |||
{{Enzyme cofactors}} | |||
[[Category:Cofactors]] | [[Category:Cofactors]] |