Cytochrome P450/ja: Difference between revisions
Cytochrome P450/ja
Created page with "==InterProサブファミリー== {{Anchor|InterPro subfamilies}} InterProサブファミリー: * シトクロムP450, B-class {{InterPro|IPR002397}} * シトクロムP450, mitochondrial {{InterPro|IPR002399}} * シトクロムP450, E-class, group I {{InterPro|IPR002401}} * シトクロムP450, E-class, group II {{InterPro|IPR002402}} * シトクロムP450, E-class, group IV {{InterPro|IPR002403}} * アロマターゼ クロザピン、..." |
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P450酵素をコードする[[Gene/ja|遺伝子]]および酵素自体は、[[protein superfamily/ja|スーパーファミリー]]を表す[[gene nomenclature/ja#Symbol and name|ルート記号]]'''CYP'''の後に、[[gene family/ja|遺伝子ファミリー]]を表す数字、サブファミリーを表す大文字、個々の遺伝子を表す別の数字が続く。遺伝子に言及する際には''[[:en:Italic type|イタリック体]]''で表記するのが慣例である。例えば、''CYP2E1'' は[[paracetamol/ja|パラセタモール]]（アセトアミノフェン）の代謝に関与する酵素の一つである[[CYP2E1/ja|CYP2E1]]をコードする遺伝子である。''CYP''命名法は公式の命名規則であるが、'''CYP450'''または'''CYP<sub>450</sub>'''が同義語として用いられることもある。これらの名称は、命名規則に従って（ファミリー番号450のP450を示すため）決して使用すべきではない。しかし、P450の遺伝子名や酵素名の中には、歴史的な名称（例えば、CYP102A1のP450<sub>BM3</sub>）や、触媒活性や基質として使用される化合物の名称を示す機能名で呼ばれるものもある。例えば、[[CYP5A1/ja|CYP5A1]]、[[thromboxane/ja|トロンボキサン]]A<sub>2</sub>合成, [[Thromboxane-A synthase/ja|TBXAS1]]（'''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''<sub>2</sub> '''S'''ynthase '''1'''）、[[CYP51A1/ja|CYP51A1]], ラノステロール14-α-デメチラーゼ、基質（'''L'''anosterol）と活性（'''D'''e'''M'''ethylation）により、非公式にLDMと略されることもある。 | P450酵素をコードする[[Gene/ja|遺伝子]]および酵素自体は、[[protein superfamily/ja|スーパーファミリー]]を表す[[gene nomenclature/ja#Symbol and name|ルート記号]]'''CYP'''の後に、[[gene family/ja|遺伝子ファミリー]]を表す数字、サブファミリーを表す大文字、個々の遺伝子を表す別の数字が続く。遺伝子に言及する際には''[[:en:Italic type|イタリック体]]''で表記するのが慣例である。例えば、''CYP2E1'' は[[paracetamol/ja|パラセタモール]]（アセトアミノフェン）の代謝に関与する酵素の一つである[[CYP2E1/ja|CYP2E1]]をコードする遺伝子である。''CYP''命名法は公式の命名規則であるが、'''CYP450'''または'''CYP<sub>450</sub>'''が同義語として用いられることもある。これらの名称は、命名規則に従って（ファミリー番号450のP450を示すため）決して使用すべきではない。しかし、P450の遺伝子名や酵素名の中には、歴史的な名称（例えば、CYP102A1のP450<sub>BM3</sub>）や、触媒活性や基質として使用される化合物の名称を示す機能名で呼ばれるものもある。例えば、[[CYP5A1/ja|CYP5A1]]、[[thromboxane/ja|トロンボキサン]]A<sub>2</sub>合成, [[Thromboxane-A synthase/ja|TBXAS1]]（'''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''<sub>2</sub> '''S'''ynthase '''1'''）、[[CYP51A1/ja|CYP51A1]], ラノステロール14-α-デメチラーゼ、基質（'''L'''anosterol）と活性（'''D'''e'''M'''ethylation）により、非公式にLDMと略されることもある。 | ||
現在の命名法ガイドラインでは、新しいCYPファミリーのメンバーは少なくとも40%の[[amino acid/ja|アミノ酸]]同一性を共有し、サブファミリーのメンバーは少なくとも55%のアミノ酸同一性を共有することが推奨されている。 | |||
現在の命名法ガイドラインでは、新しいCYPファミリーのメンバーは少なくとも40%の[[amino acid/ja|アミノ酸]]同一性を共有し、サブファミリーのメンバーは少なくとも55% | 命名法委員会は、基本遺伝子名（[http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html Cytochrome P450 Homepage] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20100627184446/http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html |date=2010-06-27 }}）と[[allele/ja|対立遺伝子]]名（[https://www.pharmvar.org// CYP Allele Nomenclature Committee]）の両方を割り当て、追跡している。 | ||
== 分類 == | == 分類 == | ||
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ヒトには57の遺伝子と59以上の[[pseudogene/ja|偽遺伝子]]があり、18のシトクロームP450遺伝子ファミリーと43のサブファミリーに分かれている。これは遺伝子とそれらがコードするタンパク質の要約である。詳しい情報はシトクロームP450命名法委員会のホームページを参照のこと。 | ヒトには57の遺伝子と59以上の[[pseudogene/ja|偽遺伝子]]があり、18のシトクロームP450遺伝子ファミリーと43のサブファミリーに分かれている。これは遺伝子とそれらがコードするタンパク質の要約である。詳しい情報はシトクロームP450命名法委員会のホームページを参照のこと。 | ||
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| '''ファミリー''' || '''機能''' || '''メンバー''' || '''遺伝子''' || '''偽遺伝子''' | | '''ファミリー''' || '''機能''' || '''メンバー''' || '''遺伝子''' || '''偽遺伝子''' | ||
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| '''CYP5''' || [[thromboxane/ja|トロンボキサン]] A<sub>2</sub> [[thromboxane-A synthase/ja|合成]] || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[Thromboxane-A synthase/ja|CYP5A1]] || | | '''CYP5''' || [[thromboxane/ja|トロンボキサン]] A<sub>2</sub> [[thromboxane-A synthase/ja|合成]] || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[Thromboxane-A synthase/ja|CYP5A1]] || | ||
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| '''CYP7''' || [[bile acid/ja| | | '''CYP7''' || [[bile acid/ja|胆汁酸]]生合成 ステロイド核の7α水酸化酵素 || 2サブファミリー, 2遺伝子 || [[CYP7A1/ja|CYP7A1]], [[CYP7B1/ja|CYP7B1]] || | ||
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| '''CYP8''' || ''さまざま'' || 2サブファミリー, 2遺伝子 || [[CYP8A1/ja|CYP8A1]] ([[prostacyclin/ja|プロスタサイクリン]]合成酵素), [[CYP8B1/ja|CYP8B1]] (胆汁酸生合成) || | | '''CYP8''' || ''さまざま'' || 2サブファミリー, 2遺伝子 || [[CYP8A1/ja|CYP8A1]] ([[prostacyclin/ja|プロスタサイクリン]]合成酵素), [[CYP8B1/ja|CYP8B1]] (胆汁酸生合成) || | ||
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| '''CYP11''' || [[steroid/ja]]生合成 || 2サブファミリー, 3遺伝子 || [[CYP11A1/ja|CYP11A1]], [[CYP11B1/ja|CYP11B1]], [[CYP11B2/ja|CYP11B2]] || | | '''CYP11''' || [[steroid/ja|ステロイド]]生合成 || 2サブファミリー, 3遺伝子 || [[CYP11A1/ja|CYP11A1]], [[CYP11B1/ja|CYP11B1]], [[CYP11B2/ja|CYP11B2]] || | ||
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| '''CYP17''' || [[steroid]] | | '''CYP17''' || [[steroid/ja|ステロイド]]生合成、17α水酸化酵素 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP17A1/ja|CYP17A1]] || | ||
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| '''CYP19''' || [[steroid/ja|ステロイド]]生合成、17α水酸化酵素: [[aromatase/ja|アロマターゼ]]は[[estrogen/ja|エストロゲン]]を合成する。 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP19A1/ja|CYP19A1]] || | | '''CYP19''' || [[steroid/ja|ステロイド]]生合成、17α水酸化酵素: [[aromatase/ja|アロマターゼ]]は[[estrogen/ja|エストロゲン]]を合成する。 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP19A1/ja|CYP19A1]] || | ||
| Line 142: | Line 140: | ||
| '''CYP20''' || 機能不明 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP20A1/ja|CYP20A1]] || | | '''CYP20''' || 機能不明 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP20A1/ja|CYP20A1]] || | ||
|- | |- | ||
| '''CYP21''' || [[steroid/ja]]生合成 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子 || [[CYP21A2/ja|CYP21A2]] || [[CYP21A1P/ja|CYP21A1P]] | | '''CYP21''' || [[steroid/ja|ステロイド]]生合成 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子 || [[CYP21A2/ja|CYP21A2]] || [[CYP21A1P/ja|CYP21A1P]] | ||
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| '''CYP24''' || [[vitamin D/ja]]劣化 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP24A1/ja|CYP24A1]] || | | '''CYP24''' || [[vitamin D/ja]]劣化 || 1サブファミリー, 1遺伝子 || [[CYP24A1/ja|CYP24A1]] || | ||
| Line 154: | Line 152: | ||
| '''CYP46''' || [[cholesterol/ja|コレステロール]]24-水酸化酵素 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子 || [[CYP46A1/ja|CYP46A1]] || CYP46A4P | | '''CYP46''' || [[cholesterol/ja|コレステロール]]24-水酸化酵素 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子 || [[CYP46A1/ja|CYP46A1]] || CYP46A4P | ||
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| '''CYP51''' || [[cholesterol/ja|コレステロール]]生合成 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 3偽遺伝子 || [[CYP51A1/ja|CYP51A1]] ([[lanosterol/ja| | | '''CYP51''' || [[cholesterol/ja|コレステロール]]生合成 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 3偽遺伝子 || [[CYP51A1/ja|CYP51A1]] ([[lanosterol/ja|ラノステロール]] 14α脱メチル化酵素) || CYP51P1, CYP51P2, CYP51P3 | ||
|} | |} | ||
== 他の種のP450 == | == 他の種のP450 == | ||