Cytochrome P450/ja: Difference between revisions

Cytochrome P450/ja
Created page with "シトクロムP450は植物の成長、発生、防御の様々な過程に関与している。P450遺伝子は植物ゲノムの約1%を占めると推定されている。これらの酵素は、様々な脂肪酸抱合体、植物ホルモン二次代謝産物リグニン、様々な防御化合物につながる。"
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P450酵素をコードする[[Gene/ja|遺伝子]]および酵素自体は、[[protein superfamily/ja|スーパーファミリー]]を表す[[gene nomenclature/ja#Symbol and name|ルート記号]]'''CYP'''の後に、[[gene family/ja|遺伝子ファミリー]]を表す数字、サブファミリーを表す大文字、個々の遺伝子を表す別の数字が続く。遺伝子に言及する際には''[[:en:Italic type|イタリック体]]''で表記するのが慣例である。例えば、''CYP2E1'' は[[paracetamol/ja|パラセタモール]](アセトアミノフェン)の代謝に関与する酵素の一つである[[CYP2E1/ja|CYP2E1]]をコードする遺伝子である。''CYP''命名法は公式の命名規則であるが、'''CYP450'''または'''CYP<sub>450</sub>'''が同義語として用いられることもある。これらの名称は、命名規則に従って(ファミリー番号450のP450を示すため)決して使用すべきではない。しかし、P450の遺伝子名や酵素名の中には、歴史的な名称(例えば、CYP102A1のP450<sub>BM3</sub>)や、触媒活性や基質として使用される化合物の名称を示す機能名で呼ばれるものもある。例えば、[[CYP5A1/ja|CYP5A1]]、[[thromboxane/ja|トロンボキサン]]A<sub>2</sub>合成, [[Thromboxane-A synthase/ja|TBXAS1]]('''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''<sub>2</sub> '''S'''ynthase '''1''')、[[CYP51A1/ja|CYP51A1]], ラノステロール14-α-デメチラーゼ、基質('''L'''anosterol)と活性('''D'''e'''M'''ethylation)により、非公式にLDMと略されることもある。
P450酵素をコードする[[Gene/ja|遺伝子]]および酵素自体は、[[protein superfamily/ja|スーパーファミリー]]を表す[[gene nomenclature/ja#Symbol and name|ルート記号]]'''CYP'''の後に、[[gene family/ja|遺伝子ファミリー]]を表す数字、サブファミリーを表す大文字、個々の遺伝子を表す別の数字が続く。遺伝子に言及する際には''[[:en:Italic type|イタリック体]]''で表記するのが慣例である。例えば、''CYP2E1'' は[[paracetamol/ja|パラセタモール]](アセトアミノフェン)の代謝に関与する酵素の一つである[[CYP2E1/ja|CYP2E1]]をコードする遺伝子である。''CYP''命名法は公式の命名規則であるが、'''CYP450'''または'''CYP<sub>450</sub>'''が同義語として用いられることもある。これらの名称は、命名規則に従って(ファミリー番号450のP450を示すため)決して使用すべきではない。しかし、P450の遺伝子名や酵素名の中には、歴史的な名称(例えば、CYP102A1のP450<sub>BM3</sub>)や、触媒活性や基質として使用される化合物の名称を示す機能名で呼ばれるものもある。例えば、[[CYP5A1/ja|CYP5A1]]、[[thromboxane/ja|トロンボキサン]]A<sub>2</sub>合成, [[Thromboxane-A synthase/ja|TBXAS1]]('''T'''hrom'''B'''o'''X'''ane '''A'''<sub>2</sub> '''S'''ynthase '''1''')、[[CYP51A1/ja|CYP51A1]], ラノステロール14-α-デメチラーゼ、基質('''L'''anosterol)と活性('''D'''e'''M'''ethylation)により、非公式にLDMと略されることもある。


<div class="mw-translate-fuzzy">
現在の命名法ガイドラインでは、新しいCYPファミリーのメンバーは少なくとも40%の[[amino acid/ja|アミノ酸]]同一性を共有し、サブファミリーのメンバーは少なくとも55%のアミノ酸同一性を共有することが推奨されている。
現在の命名法ガイドラインでは、新しいCYPファミリーのメンバーは少なくとも40%の[[amino acid/ja|アミノ酸]]同一性を共有し、サブファミリーのメンバーは少なくとも55%のアミノ酸同一性を共有することが推奨されている。命名法委員会は、基本遺伝子名([http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html Cytochrome P450 Homepage] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20100627184446/http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html |date=2010-06-27 }})と[[allele/ja|対立遺伝子]]名([https://www.pharmvar.org// CYP Allele Nomenclature Committee])の両方を割り当て、追跡している。
命名法委員会は、基本遺伝子名([http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html Cytochrome P450 Homepage] {{Webarchive|url=https://web.archive.org/web/20100627184446/http://drnelson.uthsc.edu/CytochromeP450.html |date=2010-06-27 }})と[[allele/ja|対立遺伝子]]名([https://www.pharmvar.org// CYP Allele Nomenclature Committee])の両方を割り当て、追跡している。
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== 分類 ==
== 分類 ==
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ヒトには57の遺伝子と59以上の[[pseudogene/ja|偽遺伝子]]があり、18のシトクロームP450遺伝子ファミリーと43のサブファミリーに分かれている。これは遺伝子とそれらがコードするタンパク質の要約である。詳しい情報はシトクロームP450命名法委員会のホームページを参照のこと。
ヒトには57の遺伝子と59以上の[[pseudogene/ja|偽遺伝子]]があり、18のシトクロームP450遺伝子ファミリーと43のサブファミリーに分かれている。これは遺伝子とそれらがコードするタンパク質の要約である。詳しい情報はシトクロームP450命名法委員会のホームページを参照のこと。


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{| class="wikitable"
{| class="wikitable"
| '''ファミリー''' || '''機能''' || '''メンバー''' || '''遺伝子''' || '''偽遺伝子'''
| '''ファミリー''' || '''機能''' || '''メンバー''' || '''遺伝子''' || '''偽遺伝子'''
Line 130: Line 128:
  | '''CYP5''' ||  [[thromboxane/ja|トロンボキサン]] A<sub>2</sub> [[thromboxane-A synthase/ja|合成]]  || 1サブファミリー, 1遺伝子  ||  [[Thromboxane-A synthase/ja|CYP5A1]] ||
  | '''CYP5''' ||  [[thromboxane/ja|トロンボキサン]] A<sub>2</sub> [[thromboxane-A synthase/ja|合成]]  || 1サブファミリー, 1遺伝子  ||  [[Thromboxane-A synthase/ja|CYP5A1]] ||
  |-
  |-
  | '''CYP7''' ||  [[bile acid/ja|[胆汁酸]]生合成 ステロイド核の7α水酸化酵素  || 2サブファミリー, 2遺伝子  ||  [[CYP7A1/ja|CYP7A1]], [[CYP7B1/ja|CYP7B1]] ||
  | '''CYP7''' ||  [[bile acid/ja|胆汁酸]]生合成 ステロイド核の7α水酸化酵素  || 2サブファミリー, 2遺伝子  ||  [[CYP7A1/ja|CYP7A1]], [[CYP7B1/ja|CYP7B1]] ||
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  | '''CYP8'''  || ''さまざま''  || 2サブファミリー, 2遺伝子  ||  [[CYP8A1/ja|CYP8A1]] ([[prostacyclin/ja|プロスタサイクリン]]合成酵素), [[CYP8B1/ja|CYP8B1]] (胆汁酸生合成) ||
  | '''CYP8'''  || ''さまざま''  || 2サブファミリー, 2遺伝子  ||  [[CYP8A1/ja|CYP8A1]] ([[prostacyclin/ja|プロスタサイクリン]]合成酵素), [[CYP8B1/ja|CYP8B1]] (胆汁酸生合成) ||
  |-
  |-
  | '''CYP11''' ||  [[steroid/ja]]生合成 || 2サブファミリー, 3遺伝子  ||  [[CYP11A1/ja|CYP11A1]], [[CYP11B1/ja|CYP11B1]], [[CYP11B2/ja|CYP11B2]] ||
  | '''CYP11''' ||  [[steroid/ja|ステロイド]]生合成 || 2サブファミリー, 3遺伝子  ||  [[CYP11A1/ja|CYP11A1]], [[CYP11B1/ja|CYP11B1]], [[CYP11B2/ja|CYP11B2]] ||
  |-
  |-
  | '''CYP17''' ||  [[steroid]] biosynthesis, 17-alpha hydroxylase || 1 subfamily, 1 gene   ||  [[CYP17A1]] ||
  | '''CYP17''' ||  [[steroid/ja|ステロイド]]生合成、17α水酸化酵素 || 1サブファミリー, 1遺伝子   ||  [[CYP17A1/ja|CYP17A1]] ||
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  |-
  | '''CYP19''' ||  [[steroid/ja|ステロイド]]生合成、17α水酸化酵素: [[aromatase/ja|アロマターゼ]]は[[estrogen/ja|エストロゲン]]を合成する。  || 1サブファミリー, 1遺伝子 ||  [[CYP19A1/ja|CYP19A1]] ||
  | '''CYP19''' ||  [[steroid/ja|ステロイド]]生合成、17α水酸化酵素: [[aromatase/ja|アロマターゼ]]は[[estrogen/ja|エストロゲン]]を合成する。  || 1サブファミリー, 1遺伝子 ||  [[CYP19A1/ja|CYP19A1]] ||
Line 142: Line 140:
  | '''CYP20''' ||  機能不明  || 1サブファミリー, 1遺伝子  ||  [[CYP20A1/ja|CYP20A1]] ||
  | '''CYP20''' ||  機能不明  || 1サブファミリー, 1遺伝子  ||  [[CYP20A1/ja|CYP20A1]] ||
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  |-
  | '''CYP21''' ||  [[steroid/ja]]生合成 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子  ||  [[CYP21A2/ja|CYP21A2]] || [[CYP21A1P/ja|CYP21A1P]]
  | '''CYP21''' ||  [[steroid/ja|ステロイド]]生合成 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子  ||  [[CYP21A2/ja|CYP21A2]] || [[CYP21A1P/ja|CYP21A1P]]
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  |-
  | '''CYP24''' ||  [[vitamin D/ja]]劣化 || 1サブファミリー, 1遺伝子  ||  [[CYP24A1/ja|CYP24A1]] ||
  | '''CYP24''' ||  [[vitamin D/ja]]劣化 || 1サブファミリー, 1遺伝子  ||  [[CYP24A1/ja|CYP24A1]] ||
Line 154: Line 152:
  | '''CYP46''' ||  [[cholesterol/ja|コレステロール]]24-水酸化酵素 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子  ||  [[CYP46A1/ja|CYP46A1]] || CYP46A4P
  | '''CYP46''' ||  [[cholesterol/ja|コレステロール]]24-水酸化酵素 || 1サブファミリー, 1遺伝子, 1偽遺伝子  ||  [[CYP46A1/ja|CYP46A1]] || CYP46A4P
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  |-
  | '''CYP51''' ||  [[cholesterol/ja|コレステロール]]生合成  || 1サブファミリー, 1遺伝子, 3偽遺伝子 ||  [[CYP51A1/ja|CYP51A1]] ([[lanosterol/ja|ラノステロール] 14α脱メチル化酵素) || CYP51P1, CYP51P2, CYP51P3
  | '''CYP51''' ||  [[cholesterol/ja|コレステロール]]生合成  || 1サブファミリー, 1遺伝子, 3偽遺伝子 ||  [[CYP51A1/ja|CYP51A1]] ([[lanosterol/ja|ラノステロール]] 14α脱メチル化酵素) || CYP51P1, CYP51P2, CYP51P3
|}
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== 他の種のP450 ==
== 他の種のP450 ==
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[[Cytochrome P450 aromatic O-demethylase/ja|シトクロムP450芳香族O-デメチラーゼ]]は、シトクロムP450タンパク質(GcoA)と3つのドメインのレダクターゼという、2つの異なるプロミスキャスな部分からできており、植物の細胞壁によく見られる芳香族バイオポリマーであるリグニンを、一連の異化反応において再生可能な炭素鎖に変換する能力において重要である。つまり、リグニン変換の重要なステップを促進する役割を担っているのだ。
[[Cytochrome P450 aromatic O-demethylase/ja|シトクロムP450芳香族O-デメチラーゼ]]は、シトクロムP450タンパク質(GcoA)と3つのドメインのレダクターゼという、2つの異なるプロミスキャスな部分からできており、植物の細胞壁によく見られる芳香族バイオポリマーであるリグニンを、一連の異化反応において再生可能な炭素鎖に変換する能力において重要である。つまり、リグニン変換の重要なステップを促進する役割を担っているのだ。


<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
==InterProサブファミリー==
==InterPro subfamilies==
{{Anchor|InterPro subfamilies}}
[[InterPro]] subfamilies:
[[:en:InterPro|InterPro]]サブファミリー:
* Cytochrome P450, B-class {{InterPro|IPR002397}}
* シトクロムP450, B-class {{InterPro|IPR002397}}
* Cytochrome P450, mitochondrial {{InterPro|IPR002399}}
* シトクロムP450, mitochondrial {{InterPro|IPR002399}}
* Cytochrome P450, E-class, group I {{InterPro|IPR002401}}
* シトクロムP450, E-class, group I {{InterPro|IPR002401}}
* Cytochrome P450, E-class, group II {{InterPro|IPR002402}}
* シトクロムP450, E-class, group II {{InterPro|IPR002402}}
* Cytochrome P450, E-class, group IV {{InterPro|IPR002403}}
* シトクロムP450, E-class, group IV {{InterPro|IPR002403}}
* [[Aromatase]]
* [[Aromatase/ja|アロマターゼ]]
Clozapine, imipramine, paracetamol, phenacetin Heterocyclic aryl amines
クロザピン、イミプラミン、 パラセタモール、フェナセチン 複素環式アリールアミン
Inducible and CYP1A2 5-10% deficient
誘導性でCYP1A2が5-10%欠損している。
oxidize uroporphyrinogen to uroporphyrin (CYP1A2) in heme metabolism, but they may have additional undiscovered endogenous substrates.
ヘム代謝においてウロポルフィリノーゲンをウロポルフィリンに酸化する(CYP1A2)が、他にも未発見の内因性基質があるかもしれない。
are inducible by some polycyclic hydrocarbons, some of which are found in cigarette smoke and charred food.
は、タバコの煙や焦げた食品に含まれる多環式炭化水素の一部によって誘導される。
</div>


<div lang="en" dir="ltr" class="mw-content-ltr">
これらの酵素は、アッセイにおいて化合物を発癌性物質に活性化する可能性があるため、注目されている。
These enzymes are of interest, because in assays, they can activate compounds to carcinogens.
CYP1A2の高レベルは結腸癌のリスク上昇に関連している。1A2酵素はタバコの喫煙によって誘導されるため、喫煙と大腸がんは関連している。
High levels of CYP1A2 have been linked to an increased risk of colon cancer. Since the 1A2 enzyme can be induced by cigarette smoking, this links smoking with colon cancer.
</div>


==歴史==
==歴史==