ビタミンB12欠乏症は、特に脳と神経系に深刻で不可逆的な損傷を引き起こす可能性がある。正常値よりわずかに低いレベルで欠乏すると、疲労、脱力感、ふらつき、めまい、息苦しさ、頭痛、口内炎、胃のむかつき、食欲低下などのさまざまな症状を引き起こす可能性がある、 歩行困難（ふらつきバランス障害）、筋力低下、抑うつ、記憶力低下、反射神経低下、錯乱、皮膚の青白さ、知覚異常など、特に60歳以上の人に多い。ビタミンB12欠乏症はまた、躁病や精神病の症状を引き起こすこともある。