枯草菌は遺伝子操作に非常に従順であることが証明され、実験室での研究、特に細胞分化の単純化された例である胞子形成のモデル生物として広く採用されるようになった。実験室のモデル生物としての人気という点では、枯草菌は、広く研究されているグラム陰性細菌である大腸菌と同等のグラム陽性細菌と見なされることが多い。