アミノ酸は食品の典型的な成分ではない。動物はタンパク質を食べる。タンパク質は消化の過程でアミノ酸に分解される。アミノ酸はその後、新しいタンパク質や他の生体分子の合成に使われたり、エネルギー源として尿素と二酸化炭素に酸化されたりする。酸化経路はトランスアミナーゼによるアミノ基の除去から始まり、アミノ基はその後尿素サイクルに供給される。トランスアミド化のもう1つの生成物はケト酸で、クエン酸サイクルに入る。糖原性アミノ酸はまた、糖新生によってグルコースに変換される。