プロバイオティクスは、湿疹（皮膚炎）を予防するために授乳中の母親とその幼児に一般的に投与されているが、この目的に対する有効性を示す十分な証拠はない。アトピー性皮膚炎の治療にプロバイオティクスを使用することを支持するエビデンスはほとんどなく、副作用のリスクもある。米国皮膚科学会はこう述べている： 「確立されたアトピー性皮膚炎患者の治療に対するプロバイオティクス／プレバイオティクスの使用は、一貫性のないエビデンスのため推奨されない」と述べている。