病原体の侵入から身を守るための要因は他にもある。例えば、胃の低いpH（1から4の範囲）は、そこに侵入する多くの微生物にとって致命的である。同様に、粘液（IgAを含む抗体）は多くの病原性微生物を中和する。消化管で免疫機能に寄与するその他の因子には、唾液や胆汁に分泌される酵素がある。