筋層は内側の円形層と縦方向の外側の層からなる。円形層は食物が後方に進むのを防ぎ、縦方向層は管を短くする。層は真に縦長でも円形でもなく、むしろ筋肉の層は異なるピッチでらせん状になっている。内側の円形筋層はピッチが急ならせん状で、外側の縦筋層はピッチがかなり浅いらせん状である。外側の筋層は消化管全体を通して類似しているが、例外は胃で、食物の粉砕と混合を助けるために、さらに内側の斜めの筋層がある。胃の外層筋層は、内側斜筋層、中間円筋層、外側縦筋層からなる。