ヒトゲノムには90のフラボタンパク質がコードされており、約84％はFADを、約16％はFMNを必要とする。フラボタンパク質は主にミトコンドリアに存在する。フラボタンパク質のうち90%は酸化還元反応を行い、残りの10%は転移酵素、リアーゼ、異性化酵素、リガーゼである。