魚類はほとんどの水域に豊富に存在する。高地の山岳渓流（例:イワナ、カマツカ）から、最深部の深海底域や超深海帯（例:アシロ目、ダンゴウオ科）に至るまでほぼすべての水環境に分布している。ただし海洋の最深部の25%では発見されていない。これまでに知られている最も深い海に生息する魚はアシロ目の ヨミノアシロ で、プエルトリコ海溝の水深8,370 m (27,460 ft)で記録されている。