プロバイオティクスのサプリメントを使用することの利点は、十分な臨床的証拠によって裏付けられていない。メタアナリシス研究では、プロバイオティクスを摂取している小児において、抗生物質に関連した下痢や急性下痢が緩やかに減少することが報告されている。過敏性腸症候群に関連する症状の緩和のために、プロバイオティクスを含む単菌および多菌を成人が使用することを支持するエビデンスは限られている。プロバイオティクスのサプリメントは一般的に安全と考えられている。