食物繊維は膵酵素や腸内酵素およびそれらの基質と相互作用する。ヒトの膵酵素活性は、ほとんどの食物繊維源とインキュベートすると低下する。食物繊維はアミラーゼ活性、ひいてはデンプンの加水分解速度に影響を及ぼす可能性がある。より粘性の高い多糖類は、口から盲腸までの移動時間を延長させ、グアー、トラガカント、ペクチンは小麦ふすまよりも遅い。