この情報の主要な技術的応用は代謝工学である。ここでは、酵母、植物、バクテリアなどの生物を遺伝子組み換えして、バイオテクノロジーにおいてより有用なものとし、抗生物質などの医薬品や、1,3-プロパンジオールやシキミ酸などの工業化学物質の生産を助ける。これらの遺伝子組み換えは通常、製品の生産に使われるエネルギーの量を減らし、収量を増やし、廃棄物の生産を減らすことを目的としている。